More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2402 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  82.46 
 
 		 247 aa  388  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  84.38 
 
 		 246 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  83.04 
 
 		 250 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  80.44 
 
 		 249 aa  371  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  81.36 
 
 		 249 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  80.36 
 
 		 251 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  79.91 
 
 		 246 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  78.6 
 
 		 242 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  78.6 
 
 		 242 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  78.6 
 
 		 242 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  74.9 
 
 		 249 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  74.9 
 
 		 249 aa  361  6e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  79.73 
 
 		 253 aa  359  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  74.49 
 
 		 249 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  71.07 
 
 		 249 aa  344  7e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  61.51 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  64.68 
 
 		 232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 		 237 aa  281  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  60.45 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  60.55 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  60.71 
 
 		 227 aa  271  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 225 aa  268  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  59.01 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  59.17 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  58.56 
 
 		 228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  58.72 
 
 		 227 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  57.47 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  55.71 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  59.55 
 
 		 243 aa  258  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  58.41 
 
 		 228 aa  258  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  59.09 
 
 		 243 aa  254  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  54.79 
 
 		 236 aa  254  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  59.91 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.52 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.52 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.52 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  55.66 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  54.55 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  59.09 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  59.09 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  59.09 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.09 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.09 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.09 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.09 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.09 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.09 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  56.54 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.38 
 
 		 228 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 		 226 aa  251  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.38 
 
 		 228 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.38 
 
 		 228 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.38 
 
 		 228 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.38 
 
 		 228 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  55.41 
 
 		 242 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  56.89 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  56.94 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  56.31 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  59.63 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  53.74 
 
 		 228 aa  248  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  55.41 
 
 		 250 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  57.47 
 
 		 227 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  57.47 
 
 		 227 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  57.73 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  54.34 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  58.37 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  53.7 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  59.73 
 
 		 227 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  55.09 
 
 		 230 aa  244  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  58.26 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  58.85 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  54.75 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  54.38 
 
 		 224 aa  241  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  54.95 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  51.82 
 
 		 240 aa  238  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  54.34 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  53.85 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  56.7 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  56.7 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  56.7 
 
 		 238 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  56.7 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  56.7 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  56.7 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  56.7 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  53.55 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  55.16 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  54.17 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  53.08 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  54.35 
 
 		 237 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1836  ABC transporter related  55.36 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  55.36 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  53.36 
 
 		 228 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  55.8 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  53.6 
 
 		 228 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  54.5 
 
 		 228 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>