More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2358 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  69.21 
 
 		 461 aa  648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  100 
 
 		 439 aa  919    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  68.21 
 
 		 434 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  68.74 
 
 		 441 aa  616  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  63.43 
 
 		 441 aa  565  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  44.83 
 
 		 436 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  43.92 
 
 		 454 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  44.19 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  44.01 
 
 		 444 aa  359  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  44.16 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  43.96 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  43.05 
 
 		 444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  43.48 
 
 		 444 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  42.18 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  43.51 
 
 		 444 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  43.74 
 
 		 444 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  43.15 
 
 		 444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  43.51 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  42.37 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  42.2 
 
 		 439 aa  345  8e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  41.63 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  38.96 
 
 		 443 aa  342  5.999999999999999e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  43.12 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  41.15 
 
 		 454 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  42.57 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  43.12 
 
 		 449 aa  333  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  38.83 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  40.74 
 
 		 446 aa  329  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  40.74 
 
 		 446 aa  329  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  39.22 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  38.83 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  42.49 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  41.72 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  40.96 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  39.86 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  41.04 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  40.54 
 
 		 440 aa  315  7e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  41.35 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  43.41 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  39.81 
 
 		 452 aa  312  7.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  43.18 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  38.93 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  39.95 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  42.79 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  41.31 
 
 		 474 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  39.86 
 
 		 441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4336  peptidase M24  42.32 
 
 		 389 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  41.42 
 
 		 439 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  40.27 
 
 		 465 aa  302  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  38.48 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  38.25 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  38.25 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  38.88 
 
 		 435 aa  298  9e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3277  peptidase M24  43.44 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.609187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  38.91 
 
 		 458 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  40.22 
 
 		 514 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  38.24 
 
 		 436 aa  295  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  38.81 
 
 		 442 aa  295  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  37.5 
 
 		 439 aa  295  9e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  37.19 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  36.96 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  38.88 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  36.96 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  36.96 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  36.96 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  36.96 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  38.99 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  37.1 
 
 		 438 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  37.1 
 
 		 438 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  42.05 
 
 		 446 aa  292  7e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  39.06 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  37.1 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  37.1 
 
 		 438 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  37.1 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  38.58 
 
 		 462 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  36.38 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  36.38 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  38.16 
 
 		 437 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  36.73 
 
 		 441 aa  289  8e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  36.41 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  37.72 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  37.58 
 
 		 464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0075  aminopeptidase P  39.1 
 
 		 437 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.819876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  37.58 
 
 		 464 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  37.28 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  36.14 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3406  peptidase M24  39.36 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  38.67 
 
 		 439 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  37.07 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  35.55 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3287  aminopeptidase P  38.9 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1524  aminopeptidase P  35.57 
 
 		 430 aa  276  5e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0210879  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  38.48 
 
 		 458 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  37.28 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  37.33 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2176  aminopeptidase P  40.38 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  38.91 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2360  Xaa-Pro aminopeptidase  38.43 
 
 		 468 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3358  xaa-pro aminopeptidase  38.43 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2540  Xaa-Pro aminopeptidase  38.43 
 
 		 481 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>