More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2209 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1158 aa  2328    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  50.17 
 
 
1151 aa  1063    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.11 
 
 
836 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.95 
 
 
835 aa  533  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.56 
 
 
835 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.69 
 
 
835 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  41.88 
 
 
818 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.67 
 
 
775 aa  505  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  40.38 
 
 
840 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.44 
 
 
692 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.08 
 
 
1272 aa  335  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.18 
 
 
1336 aa  330  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.2 
 
 
639 aa  317  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.91 
 
 
1212 aa  295  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.32 
 
 
466 aa  291  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.471806  normal  0.498219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.36 
 
 
1217 aa  288  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.73 
 
 
519 aa  281  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.93 
 
 
547 aa  281  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.32 
 
 
625 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3558  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.19 
 
 
450 aa  258  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0486  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.1 
 
 
742 aa  247  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.690821  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.6 
 
 
1383 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.45 
 
 
1085 aa  234  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0274  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.52 
 
 
440 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  39.52 
 
 
1096 aa  213  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.51 
 
 
1092 aa  210  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.63 
 
 
995 aa  205  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  37.14 
 
 
397 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  37.14 
 
 
397 aa  199  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  37.14 
 
 
397 aa  199  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  37.14 
 
 
397 aa  199  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  37.14 
 
 
397 aa  199  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.77 
 
 
487 aa  198  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  37.4 
 
 
397 aa  197  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.35 
 
 
495 aa  194  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  36.87 
 
 
397 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  36.87 
 
 
397 aa  193  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.99 
 
 
639 aa  192  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.82 
 
 
583 aa  192  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  36.34 
 
 
397 aa  191  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.81 
 
 
724 aa  187  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.62 
 
 
771 aa  186  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.1 
 
 
490 aa  184  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3698  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.66 
 
 
748 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.93 
 
 
721 aa  179  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.73 
 
 
1876 aa  177  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.16 
 
 
397 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.59 
 
 
653 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.8 
 
 
805 aa  174  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.26 
 
 
577 aa  172  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1944  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 
638 aa  171  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.69 
 
 
594 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.9 
 
 
399 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  36.42 
 
 
399 aa  166  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4812  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.13 
 
 
912 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.42 
 
 
479 aa  164  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.42 
 
 
680 aa  164  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.95 
 
 
627 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.84 
 
 
452 aa  162  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  37.4 
 
 
502 aa  162  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.06 
 
 
1454 aa  161  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.02 
 
 
453 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.71 
 
 
648 aa  160  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2524  subtilisin-like serine protease  35.83 
 
 
1116 aa  159  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  36.86 
 
 
497 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  36.86 
 
 
500 aa  158  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11721  hypothetical protein  41.26 
 
 
495 aa  158  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.144634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2156  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.48 
 
 
401 aa  157  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.94 
 
 
557 aa  157  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.07 
 
 
797 aa  156  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.25 
 
 
769 aa  156  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  37.46 
 
 
497 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  35.46 
 
 
485 aa  155  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.91 
 
 
638 aa  155  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1707  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.83 
 
 
737 aa  153  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.37 
 
 
587 aa  153  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.42 
 
 
587 aa  151  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.11 
 
 
587 aa  150  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.15 
 
 
1029 aa  148  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  37.19 
 
 
533 aa  148  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.91 
 
 
669 aa  148  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.89 
 
 
370 aa  147  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.71 
 
 
415 aa  146  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0715  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.31 
 
 
541 aa  146  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10331  hypothetical protein  35.56 
 
 
482 aa  146  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  32.89 
 
 
576 aa  145  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  36.95 
 
 
692 aa  144  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.43 
 
 
636 aa  144  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  34.13 
 
 
560 aa  142  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2053  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.48 
 
 
777 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.04 
 
 
689 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.42 
 
 
597 aa  140  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.44 
 
 
882 aa  140  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.47 
 
 
577 aa  140  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5185  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 
605 aa  140  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  35.86 
 
 
560 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.96 
 
 
579 aa  138  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3992  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.33 
 
 
555 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355487  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  31.36 
 
 
454 aa  137  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.39 
 
 
597 aa  137  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>