More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2197 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 299 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  92.98 
 
 		 299 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  90.64 
 
 		 299 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  90.64 
 
 		 299 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  90.97 
 
 		 331 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  91.3 
 
 		 332 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  90.64 
 
 		 299 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  90.64 
 
 		 299 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  90.64 
 
 		 299 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  90.97 
 
 		 299 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  90.64 
 
 		 324 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  90.64 
 
 		 299 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  88.63 
 
 		 299 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  89.63 
 
 		 299 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  86.96 
 
 		 299 aa  541  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  87.76 
 
 		 297 aa  537  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  67.45 
 
 		 299 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  67.79 
 
 		 299 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  67.45 
 
 		 299 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  67.79 
 
 		 299 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  67.79 
 
 		 299 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  67.45 
 
 		 299 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  67.79 
 
 		 299 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  67.79 
 
 		 299 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  67.79 
 
 		 299 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  66.11 
 
 		 299 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  66.11 
 
 		 299 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  66.11 
 
 		 299 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  66.11 
 
 		 299 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  66.11 
 
 		 299 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  66.78 
 
 		 299 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  67.11 
 
 		 299 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  66.11 
 
 		 299 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  66.44 
 
 		 299 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  66.22 
 
 		 298 aa  407  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  65.44 
 
 		 299 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  65.44 
 
 		 299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  65.44 
 
 		 299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  65.44 
 
 		 299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  66.22 
 
 		 298 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  65.44 
 
 		 299 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  65.1 
 
 		 299 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  65 
 
 		 300 aa  394  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  64.09 
 
 		 299 aa  397  1e-109  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  63.85 
 
 		 304 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  63.82 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  65.77 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  65.77 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 298 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  63.55 
 
 		 299 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  64.09 
 
 		 299 aa  384  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3889  ATP phosphoribosyltransferase  60.2 
 
 		 300 aa  356  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  52.54 
 
 		 293 aa  301  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  45.67 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  46.44 
 
 		 286 aa  266  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  47.46 
 
 		 286 aa  265  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 		 284 aa  262  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  44.75 
 
 		 294 aa  260  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  45.92 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  43.05 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  42.03 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  42.47 
 
 		 285 aa  238  5.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1420  ATP phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 		 304 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  43.15 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1353  ATP phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 288 aa  168  9e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 284 aa  155  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 282 aa  155  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  34.47 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  33.77 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 282 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  32.34 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>