More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2144 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 317 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  82.2 
 
 		 312 aa  544  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  79.29 
 
 		 314 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  78.14 
 
 		 314 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  78.53 
 
 		 314 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  78.64 
 
 		 314 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  78.96 
 
 		 314 aa  511  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  77.88 
 
 		 314 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  77.67 
 
 		 314 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  77.67 
 
 		 314 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  77.67 
 
 		 314 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  77.67 
 
 		 314 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  76.05 
 
 		 338 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  76.38 
 
 		 313 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  75.64 
 
 		 313 aa  490  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  72.49 
 
 		 313 aa  472  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  75.64 
 
 		 314 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  70 
 
 		 314 aa  455  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  68.39 
 
 		 313 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  67.09 
 
 		 317 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  63.14 
 
 		 319 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  57.47 
 
 		 311 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  57.47 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  57.79 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  57.47 
 
 		 311 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  57.47 
 
 		 311 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  57.61 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  57.19 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  57.79 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  57.79 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  52.9 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  53.05 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  53.05 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  52.73 
 
 		 309 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  50.8 
 
 		 309 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  52.43 
 
 		 310 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  51.94 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  51.94 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  52.58 
 
 		 308 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  52.58 
 
 		 308 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  51.13 
 
 		 316 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  53.07 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  50.97 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  50.97 
 
 		 306 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  50.97 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  50 
 
 		 306 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  50.65 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  50.32 
 
 		 306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  50.32 
 
 		 306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  50.32 
 
 		 306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  50.32 
 
 		 306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  50 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  50.97 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  50.81 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  49.36 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  48.38 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  47.91 
 
 		 308 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  47.59 
 
 		 312 aa  291  8e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  48.55 
 
 		 308 aa  291  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  47.4 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  47.59 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  48.17 
 
 		 306 aa  287  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  49.02 
 
 		 306 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  46.3 
 
 		 313 aa  286  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  45.95 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  44.69 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  48.22 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  44.69 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  42.95 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  44.37 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  43.1 
 
 		 307 aa  255  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  43.73 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  43.73 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  47.2 
 
 		 248 aa  223  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  38.6 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  37.54 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  38.6 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  36.49 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  37.42 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  36.34 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  37.32 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  36.49 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  36.49 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  36.39 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  36.39 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  37.19 
 
 		 298 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  37.19 
 
 		 298 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  37.19 
 
 		 298 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  36.14 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  37.19 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  35.62 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  36.17 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  35.92 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  35.64 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  36.52 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  35.79 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  34.71 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  35.09 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>