31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2017 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2017  DsrH like protein  100 
 
 		 93 aa  184  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000931832  hitchhiker  0.000744283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  58.06 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  52.04 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  50.54 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  50.54 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  50.54 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  49.46 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1801  hypothetical protein  48.04 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13849  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  49.46 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000886637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  49.46 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267344  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  49.46 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000019534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  49.46 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  49.46 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000377209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2108  DsrH family protein  50.54 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2133  DsrH family protein  50.7 
 
 		 71 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0139279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  41.24 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2347  putative sulfur oxidation protein DsrH  31.58 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  36.46 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.42 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  33.33 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  29.9 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1521  hypothetical protein  35.16 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  31.63 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  31.63 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  30.21 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  27.84 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  26.8 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.69 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000247543  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  31.31 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>