103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1937 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  80.8 
 
 
375 aa  651  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  80.21 
 
 
374 aa  642  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  83.73 
 
 
375 aa  666  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.28738e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  80.8 
 
 
375 aa  650  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  83.73 
 
 
375 aa  671  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  5.68724e-06  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  80.8 
 
 
375 aa  650  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  80.8 
 
 
375 aa  650  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  7.23635e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
375 aa  782  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  79.73 
 
 
375 aa  643  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  78.61 
 
 
376 aa  636  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  82.13 
 
 
375 aa  655  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  79.47 
 
 
375 aa  638  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  78.4 
 
 
375 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  78.93 
 
 
375 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  1.23678e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  78.67 
 
 
375 aa  629  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  78.93 
 
 
375 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  74.13 
 
 
375 aa  605  1e-172  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  72.49 
 
 
378 aa  587  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.13 
 
 
379 aa  561  1e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  56.15 
 
 
400 aa  459  1e-128  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  55.61 
 
 
374 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.14112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  56.45 
 
 
376 aa  447  1e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  56 
 
 
375 aa  441  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  55.79 
 
 
380 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  52.14 
 
 
374 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  54.4 
 
 
379 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  53.44 
 
 
383 aa  418  1e-115  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.22 
 
 
384 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.2 
 
 
375 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  50.67 
 
 
381 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.48 
 
 
384 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.13 
 
 
380 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.54 
 
 
380 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.81 
 
 
380 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  49.21 
 
 
384 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  50.13 
 
 
381 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.68 
 
 
388 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  50.14 
 
 
379 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  48.81 
 
 
384 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  49.08 
 
 
384 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  48.81 
 
 
384 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  49.08 
 
 
384 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  49.08 
 
 
384 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  48.81 
 
 
384 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  48.81 
 
 
384 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  50.4 
 
 
381 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.4 
 
 
383 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.73445e-07  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  49.31 
 
 
384 aa  362  7e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.76 
 
 
384 aa  361  9e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  46.28 
 
 
382 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  46.01 
 
 
375 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  46.01 
 
 
375 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.79 
 
 
384 aa  357  1e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.79 
 
 
384 aa  357  1e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.38 
 
 
384 aa  355  9e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.38 
 
 
384 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.11 
 
 
384 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.11 
 
 
384 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.63 
 
 
369 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  45.48 
 
 
382 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  44.95 
 
 
382 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  45.21 
 
 
382 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.15 
 
 
378 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.35 
 
 
376 aa  319  4e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  41.18 
 
 
459 aa  280  3e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.29 
 
 
405 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  26.67 
 
 
463 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2784  hypothetical protein  24.69 
 
 
340 aa  84  4e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.53 
 
 
398 aa  68.6  2e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.57 
 
 
393 aa  61.6  2e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  24.35 
 
 
429 aa  60.5  5e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.03 
 
 
497 aa  59.7  9e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.77 
 
 
439 aa  57  5e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  28.24 
 
 
821 aa  53.5  6e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 
557 aa  52.8  1e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.83 
 
 
406 aa  50.8  4e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.58618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  26.09 
 
 
403 aa  50.1  7e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.15 
 
 
428 aa  49.7  9e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.93 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  31.36 
 
 
490 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.3 
 
 
609 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.51 
 
 
559 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.94 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  29.59 
 
 
615 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  25.53 
 
 
606 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.03 
 
 
683 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.03 
 
 
684 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.95 
 
 
1034 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.03 
 
 
683 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.03 
 
 
683 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.03 
 
 
659 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.03 
 
 
658 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  31.03 
 
 
840 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.35 
 
 
558 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  28.03 
 
 
627 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.63 
 
 
563 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  1.96465e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.85 
 
 
612 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.95 
 
 
628 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.39 
 
 
665 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.39 
 
 
627 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  3.5744e-08 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>