More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1905 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4796  hypothetical protein  49.15 
 
 
695 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2223  peptidase, putative  77 
 
 
687 aa  1125    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.56 
 
 
683 aa  1120    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000205903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  83.46 
 
 
684 aa  1218    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.09 
 
 
709 aa  652    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1905  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
685 aa  1424    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.56 
 
 
683 aa  1120    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000111098  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  74.67 
 
 
683 aa  1104    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2123  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  76.27 
 
 
687 aa  1122    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2199  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  76.42 
 
 
687 aa  1123    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000634977  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  75.18 
 
 
686 aa  1110    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2228  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  84.19 
 
 
684 aa  1206    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0618866  hitchhiker  0.00768249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2696  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  48.71 
 
 
720 aa  651    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8559  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1919  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.68 
 
 
682 aa  1119    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000323792  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2039  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  81.7 
 
 
683 aa  1205    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.033765  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1808  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  75.4 
 
 
687 aa  1134    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  76.13 
 
 
687 aa  1120    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000361808  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  77.56 
 
 
683 aa  1119    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  75 
 
 
684 aa  1107    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1385  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.08 
 
 
688 aa  623  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3102  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  46 
 
 
700 aa  614  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1091  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.03 
 
 
692 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1455  alanyl dipeptidyl peptidase  46.26 
 
 
717 aa  611  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02099  alanyl dipeptidyl peptidase  45.27 
 
 
713 aa  611  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1094  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.93 
 
 
680 aa  581  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.764126  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.99 
 
 
698 aa  511  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0933  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.21 
 
 
668 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.115287  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  37.42 
 
 
674 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.82 
 
 
674 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.52 
 
 
674 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.43 
 
 
688 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.92 
 
 
687 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  32.23 
 
 
648 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0591  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.69 
 
 
675 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  32.36 
 
 
675 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.22 
 
 
681 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.07 
 
 
681 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.07 
 
 
681 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.71 
 
 
675 aa  347  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.47 
 
 
680 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.73 
 
 
675 aa  342  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.85 
 
 
698 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.31 
 
 
673 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.7 
 
 
673 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.32 
 
 
698 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  31.83 
 
 
688 aa  335  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00800  peptidase, putative  31.34 
 
 
750 aa  333  6e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.54 
 
 
681 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.18 
 
 
690 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10198  oligopeptidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04730)  33.45 
 
 
729 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.42 
 
 
633 aa  305  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02572  hypothetical dipeptidyl-peptidase (Eurofung)  30.17 
 
 
722 aa  303  8.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459981  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.23 
 
 
633 aa  301  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.79 
 
 
668 aa  275  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.55 
 
 
695 aa  272  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.33 
 
 
668 aa  250  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.38 
 
 
672 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.03 
 
 
697 aa  240  8e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.07 
 
 
666 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.28 
 
 
670 aa  231  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.83 
 
 
673 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.97 
 
 
666 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0779604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3633  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.97 
 
 
666 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.95 
 
 
700 aa  224  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.955873  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3954  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.98 
 
 
694 aa  224  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.871148  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.36 
 
 
688 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.98 
 
 
661 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.73 
 
 
678 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.53 
 
 
704 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0880846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.29 
 
 
652 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.92 
 
 
680 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.27 
 
 
667 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01350  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26.28 
 
 
721 aa  201  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.24 
 
 
677 aa  194  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0169  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.03 
 
 
709 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.78 
 
 
708 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.29 
 
 
717 aa  191  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.26 
 
 
716 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.48 
 
 
720 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.75 
 
 
692 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.63 
 
 
660 aa  180  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.63 
 
 
697 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.69 
 
 
726 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5739  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.22 
 
 
735 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.11 
 
 
695 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.77 
 
 
686 aa  172  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.86 
 
 
762 aa  171  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  24.33 
 
 
685 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.15 
 
 
682 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.59 
 
 
766 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.21 
 
 
712 aa  160  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.98 
 
 
661 aa  160  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.68 
 
 
701 aa  160  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  37.61 
 
 
719 aa  158  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.36 
 
 
631 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.58 
 
 
692 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  21.98 
 
 
704 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.77 
 
 
617 aa  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  25.66 
 
 
632 aa  144  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.77 
 
 
666 aa  143  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>