18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1854 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1854  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  927    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000041317  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0708  hypothetical protein  45.21 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000336501  decreased coverage  0.0000114896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3720  hypothetical protein  44.74 
 
 		 455 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000107792  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4018  hypothetical protein  34.59 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0537  hypothetical protein  34.96 
 
 		 457 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3585  hypothetical protein  34.51 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3415  hypothetical protein  34.73 
 
 		 457 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636274 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3258  hypothetical protein  31.94 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.859487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3741  hypothetical protein  30.7 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0623  hypothetical protein  30.48 
 
 		 456 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0650  hypothetical protein  30.48 
 
 		 456 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0646  hypothetical protein  30.26 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2602  hypothetical protein  31.43 
 
 		 460 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0209779  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03457  hypothetical protein  30.02 
 
 		 464 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000189701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3568  hypothetical protein  27.29 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000948267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0144  putative lipoprotein  23.35 
 
 		 506 aa  94.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1430  putative lipoprotein  22.15 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000120466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  19.78 
 
 		 819 aa  43.1  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>