73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1683 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1683  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0614487  unclonable  0.00000199628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3180  hypothetical protein  72.22 
 
 		 189 aa  284  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.588963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2756  hypothetical protein  74.3 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665194  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1428  hypothetical protein  78.7 
 
 		 184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1715  hypothetical protein  78.11 
 
 		 183 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1353  hypothetical protein  77.19 
 
 		 180 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2743  hypothetical protein  78.11 
 
 		 182 aa  280  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0230588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2825  protein of unknown function DUF1415  76.92 
 
 		 182 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2635  hypothetical protein  77.51 
 
 		 182 aa  279  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1526  hypothetical protein  76.33 
 
 		 182 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112476  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2568  hypothetical protein  77.51 
 
 		 182 aa  279  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1559  hypothetical protein  75.74 
 
 		 182 aa  277  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1492  hypothetical protein  67.76 
 
 		 202 aa  276  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0122301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1530  hypothetical protein  75.74 
 
 		 182 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1393  hypothetical protein  67.96 
 
 		 186 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0285397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2233  hypothetical protein  68.6 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1845  hypothetical protein  62.57 
 
 		 183 aa  235  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2979  hypothetical protein  53.18 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2030  hypothetical protein  47.46 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1157  hypothetical protein  47.06 
 
 		 189 aa  180  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3140  hypothetical protein  46.02 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0840937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2881  hypothetical protein  46.02 
 
 		 183 aa  164  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2192  hypothetical protein  41.76 
 
 		 183 aa  154  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2220  hypothetical protein  42.35 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1556  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.996386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2224  protein of unknown function DUF1415  40.24 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02963  hypothetical protein  42.22 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.058158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03086  hypothetical protein  39.31 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003684  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02137  hypothetical protein  40.94 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3491  protein of unknown function DUF1415  40.37 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2114  hypothetical protein  38.42 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0293  hypothetical protein  42.04 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1226  hypothetical protein  44.08 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3629  hypothetical protein  39.29 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2733  hypothetical protein  42.24 
 
 		 189 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3616  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2963  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.351971  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3604  hypothetical protein  39.29 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1040  hypothetical protein  39.08 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3518  hypothetical protein  38.75 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.0960995 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2809  hypothetical protein  38.69 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1734  hypothetical protein  38.69 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0032  hypothetical protein  38.69 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3168  hypothetical protein  38.69 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2941  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0424  hypothetical protein  37.43 
 
 		 184 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3534  protein of unknown function DUF1415  38.5 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0429  hypothetical protein  40.37 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0403  hypothetical protein  40.37 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3586  hypothetical protein  36.52 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0544  hypothetical protein  33.14 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0480  hypothetical protein  33.14 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0870  hypothetical protein  35.59 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0351684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2899  hypothetical protein  35.39 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5572  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2929  hypothetical protein  37.13 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0471  hypothetical protein  38.51 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1005  hypothetical protein  37.13 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0498  hypothetical protein  38.51 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2607  hypothetical protein  38.51 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1149  protein of unknown function DUF1415  38.99 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1818  protein of unknown function DUF1415  38.31 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0209901  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1246  hypothetical protein  37.13 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2457  hypothetical protein  38.18 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3336  protein of unknown function DUF1415  40.37 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0706  protein of unknown function DUF1415  35.37 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3054  hypothetical protein  40.62 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2989  protein of unknown function DUF1415  38.15 
 
 		 249 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36742  predicted protein  30.61 
 
 		 288 aa  95.1  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.905252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0737  hypothetical protein  34.07 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33635  predicted protein  31.61 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.728091  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45717  predicted protein  26.45 
 
 		 615 aa  48.5  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>