More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1677 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  78.59 
 
 		 453 aa  763    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  79.69 
 
 		 453 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 453 aa  929    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  75.61 
 
 		 453 aa  724    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  62.91 
 
 		 453 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  51.89 
 
 		 461 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  48.21 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  47.98 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  48.21 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  47.98 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  50.22 
 
 		 476 aa  418  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  49.23 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  47.12 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  49.55 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  49.56 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  49.56 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  49.77 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  51.96 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  50.25 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  49.76 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  49.57 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  48.94 
 
 		 460 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  49.65 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  51.79 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  45.78 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  49.28 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  47.69 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  47.57 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  46.95 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  47.57 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  49.88 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  46.97 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  49.88 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  47.48 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  48.11 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  49.04 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  46.51 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  47.33 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  46.29 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  48.09 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  44.01 
 
 		 460 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  46.24 
 
 		 460 aa  362  6e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  46.51 
 
 		 469 aa  361  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  49.63 
 
 		 460 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  46.07 
 
 		 479 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  43.24 
 
 		 473 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  44.52 
 
 		 467 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  46.17 
 
 		 469 aa  349  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  47.07 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  45.54 
 
 		 456 aa  342  7e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  43.72 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  46.37 
 
 		 455 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  45.6 
 
 		 463 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 452 aa  326  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  47.44 
 
 		 547 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  43.68 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  45.14 
 
 		 411 aa  297  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40.1 
 
 		 497 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  37.83 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  39.51 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  39.01 
 
 		 491 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  38.36 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  39.18 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  37.99 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  38.36 
 
 		 508 aa  230  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  41.13 
 
 		 515 aa  230  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  40 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  36.48 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  35.96 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  40.06 
 
 		 499 aa  227  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  40.95 
 
 		 483 aa  226  7e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  37.91 
 
 		 488 aa  226  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  39.51 
 
 		 522 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  40.95 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15321  leucyl aminopeptidase  36.41 
 
 		 490 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 		 503 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1430  leucyl aminopeptidase  36.19 
 
 		 490 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  41.64 
 
 		 501 aa  222  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  38.06 
 
 		 496 aa  222  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 		 503 aa  222  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  41.35 
 
 		 503 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  40.51 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02660  leucyl aminopeptidase  41.96 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  39.08 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  40.31 
 
 		 499 aa  221  3e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15181  leucyl aminopeptidase  36.68 
 
 		 490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  36.41 
 
 		 514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  41.03 
 
 		 503 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  39.2 
 
 		 500 aa  220  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  41.03 
 
 		 503 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  41.03 
 
 		 503 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  42.39 
 
 		 479 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  39.05 
 
 		 507 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0536  leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  36.11 
 
 		 488 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  37.82 
 
 		 500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  41.4 
 
 		 503 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  38.23 
 
 		 497 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0098  leucyl aminopeptidase  41.16 
 
 		 491 aa  217  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>