More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1660 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
166 aa  340  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  78.92 
 
 
166 aa  278  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  69.28 
 
 
166 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3255  GCN5-related N-acetyltransferase  68.07 
 
 
171 aa  241  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  65.24 
 
 
165 aa  231  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  64.63 
 
 
165 aa  230  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  64.02 
 
 
165 aa  228  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  63.41 
 
 
170 aa  226  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  60.98 
 
 
165 aa  220  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  60.98 
 
 
165 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  60.98 
 
 
165 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  60.98 
 
 
165 aa  217  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  64.81 
 
 
174 aa  215  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  60.37 
 
 
165 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  65.87 
 
 
167 aa  213  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
175 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 
174 aa  101  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  34.73 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  36.11 
 
 
201 aa  98.2  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
176 aa  90.9  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2707  acetyltransferase  35.62 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  34.93 
 
 
167 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  34.93 
 
 
165 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  34.93 
 
 
167 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
165 aa  87.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  34.84 
 
 
180 aa  87.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  34.84 
 
 
180 aa  87.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.905398  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
165 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
190 aa  85.1  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
181 aa  84.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  33.73 
 
 
178 aa  84  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1460  acetyltransferase  30.77 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.176845  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2744  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
175 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  33.77 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3519  acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein  33.72 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.420967  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  32.9 
 
 
186 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  32.69 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  33.11 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2074  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  35.17 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0548891  normal  0.0970002 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  32.89 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  29.17 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  31.61 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2047  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  31.9 
 
 
529 aa  74.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  27.98 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  31.25 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  29.56 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3536  acetyltransferase  28.22 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
175 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
190 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
194 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  33.78 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  29.48 
 
 
188 aa  70.5  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  29.34 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1507  putative acetyltransferase  30.2 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  25.47 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  33.56 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  33.56 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.56 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  33.56 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  33.56 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.34 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1743  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>