185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1640 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1640  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1339  hypothetical protein  84.75 
 
 		 61 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1559  hypothetical protein  84.21 
 
 		 59 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.730399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2672  protein of unknown function DUF343  79.66 
 
 		 59 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0296171  normal  0.0260721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  82.46 
 
 		 59 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  82.46 
 
 		 59 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  82.46 
 
 		 59 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1685  hypothetical protein  79.66 
 
 		 59 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1707  hypothetical protein  79.66 
 
 		 59 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.502492  normal  0.508919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  84.21 
 
 		 58 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1670  hypothetical protein  79.66 
 
 		 59 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2800  hypothetical protein  77.97 
 
 		 59 aa  98.2  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2824  hypothetical protein  78.95 
 
 		 60 aa  97.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  82.46 
 
 		 57 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2386  hypothetical protein  84.91 
 
 		 58 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2197  hypothetical protein  75 
 
 		 56 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2127  hypothetical protein  71.43 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0473913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01537  hypothetical protein  78 
 
 		 59 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003985  protein ycaR  78 
 
 		 59 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1467  hypothetical protein  70.37 
 
 		 59 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01858  hypothetical protein  62.5 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1964  hypothetical protein  61.11 
 
 		 60 aa  74.7  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2572  hypothetical protein  61.11 
 
 		 60 aa  74.7  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  64 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2661  hypothetical protein  61.11 
 
 		 60 aa  74.7  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  64 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2206  protein of unknown function DUF343  66 
 
 		 60 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1718  hypothetical protein  66 
 
 		 60 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1782  hypothetical protein  60.66 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.188644  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  55.36 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2307  protein of unknown function DUF343  64 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.858072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  62.5 
 
 		 59 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  60 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  60 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  60 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  56.36 
 
 		 430 aa  71.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  60 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  60 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  58 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  55.36 
 
 		 63 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  56 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  56 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0993  hypothetical protein  62 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638813  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597a  conserved cytosolic protein  53.57 
 
 		 56 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.772471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1052  hypothetical protein  62 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.202264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  58 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0657  hypothetical protein  56 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.255489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  62 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  56 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  56 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  56 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  56 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  56 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  62 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1020  hypothetical protein  62 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.678169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  56 
 
 		 62 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1922  hypothetical protein  51.79 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  56 
 
 		 62 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  62 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  62 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00921  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0400201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2726  protein of unknown function DUF343  60 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  50.91 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  54 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00928  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2679  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.10182  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  57.63 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1015  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00271663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1024  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0234361  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1078  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00247062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1436  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2407  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.025157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2203  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.29986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2556  hypothetical protein  45.61 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  45.45 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  49.09 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  51.79 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2950  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  54.9 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  49.09 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  52.83 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  53.45 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  52.94 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0902  hypothetical protein  53.57 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0351065  normal  0.893106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  52.94 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  51.79 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3569  hypothetical protein  46.43 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0331586  hitchhiker  0.00582787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  44.64 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  51.85 
 
 		 61 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  46.43 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1895  hypothetical protein  60 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  46.55 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  49.09 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  50.98 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>