28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1631 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1631  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000294763  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2832  hypothetical protein  55.72 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000632951  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1812  hypothetical protein  55.5 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.028303  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2510  hypothetical protein  53.3 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0427588  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1953  hypothetical protein  51.85 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38277  normal  0.0743494 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  56.28 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  56 
 
 		 206 aa  214  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2405  hypothetical protein  51.39 
 
 		 223 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00249071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2394  hypothetical protein  51.39 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000175566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1544  hypothetical protein  52.36 
 
 		 194 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00234797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  55.5 
 
 		 206 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  55.28 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2157  hypothetical protein  54.12 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311546  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1675  hypothetical protein  50.23 
 
 		 222 aa  192  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220526  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1331  hypothetical protein  51.87 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.921495  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2398  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  34.03 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  29.79 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0695  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3480  hypothetical protein  29.19 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1475  hypothetical protein  25.13 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003993  hypothetical protein  27.07 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.945378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01529  hypothetical protein  25.13 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1694  type IV pilus assembly PilZ  25.48 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2153  type IV pilus assembly PilZ  25.48 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3589  type IV pilus assembly PilZ  25.48 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  23.53 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1670  type IV pilus assembly PilZ  22.29 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>