160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1590 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  85.66 
 
 		 290 aa  511  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  83.15 
 
 		 279 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  83.15 
 
 		 279 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  81.72 
 
 		 279 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  82.8 
 
 		 279 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  81.72 
 
 		 279 aa  487  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  81.72 
 
 		 279 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  81.72 
 
 		 279 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  81.72 
 
 		 279 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  81.72 
 
 		 279 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  81.72 
 
 		 279 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  78.85 
 
 		 279 aa  480  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  80.65 
 
 		 279 aa  478  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  79.21 
 
 		 279 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  78.14 
 
 		 279 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  74.55 
 
 		 279 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  73.48 
 
 		 279 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  73.12 
 
 		 279 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  71.68 
 
 		 279 aa  431  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  67.99 
 
 		 279 aa  407  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  64.75 
 
 		 280 aa  394  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  61.8 
 
 		 287 aa  338  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  48.01 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  36.03 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  34.9 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  36.39 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  33.44 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  32.08 
 
 		 311 aa  141  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  33.02 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  32.64 
 
 		 320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  34.12 
 
 		 348 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  33 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  31.23 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  30.94 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  31.31 
 
 		 316 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  32.9 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  32.66 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  30.33 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  29.89 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  29.48 
 
 		 330 aa  97.1  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  29.17 
 
 		 316 aa  96.3  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.21 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  29.03 
 
 		 327 aa  92  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  34.62 
 
 		 313 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  30.86 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  26.28 
 
 		 337 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  26.94 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  28 
 
 		 321 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  29.1 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  44.62 
 
 		 346 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  25.84 
 
 		 337 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  29.55 
 
 		 341 aa  85.9  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  28.15 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  29.89 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  28.32 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  28.09 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  26.59 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  28.16 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  31.62 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  31.62 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  27.96 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  31.62 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  26.77 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  34.38 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  29.66 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  26.57 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  27.65 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  31.74 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.24 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51972  flavonol synthase  39.68 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.842126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  26.67 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  27.1 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  29.96 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  29.38 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  28.94 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  28.94 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  29.06 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  28.1 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  25 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  26.44 
 
 		 564 aa  73.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  42.2 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  42.2 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  28.14 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  42.2 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  28.07 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  28.74 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  27.24 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  44.04 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  24.67 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  27.38 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  27.97 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  23.7 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  36.19 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  27.14 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02390  conserved hypothetical protein  27.76 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  27.97 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31624  predicted protein  29.67 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  hitchhiker  0.00491035 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>