234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1586 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1586  diacylglycerol kinase  100 
 
 
123 aa  244  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.117839  normal  0.376831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1483  diacylglycerol kinase  75.61 
 
 
123 aa  201  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0058197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2640  diacylglycerol kinase  82.2 
 
 
123 aa  200  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.185704  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1747  diacylglycerol kinase  80.99 
 
 
123 aa  199  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1885  diacylglycerol kinase  79.67 
 
 
170 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1837  diacylglycerol kinase  79.67 
 
 
123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000673614  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1851  diacylglycerol kinase  79.67 
 
 
123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000916296  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2402  diacylglycerol kinase  79.34 
 
 
123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.802663  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2192  diacylglycerol kinase  77.69 
 
 
123 aa  191  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0610811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2269  diacylglycerol kinase  77.69 
 
 
123 aa  191  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2512  diacylglycerol kinase  78.33 
 
 
123 aa  190  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361912  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2203  diacylglycerol kinase  79.82 
 
 
134 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1989  diacylglycerol kinase  73.73 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452736 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2308  diacylglycerol kinase  71.54 
 
 
126 aa  174  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00356562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1996  diacylglycerol kinase  69.92 
 
 
123 aa  174  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102792  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0531  diacylglycerol kinase  63.25 
 
 
128 aa  143  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000113671  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03914  diacylglycerol kinase  54.24 
 
 
122 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.299817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3951  diacylglycerol kinase  54.24 
 
 
122 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4595  diacylglycerol kinase  54.24 
 
 
122 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4555  diacylglycerol kinase  54.24 
 
 
122 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4282  diacylglycerol kinase  54.24 
 
 
122 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3986  diacylglycerol kinase  54.24 
 
 
122 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.345004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5523  diacylglycerol kinase  54.24 
 
 
122 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.351191  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4504  diacylglycerol kinase  54.24 
 
 
122 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03874  hypothetical protein  54.24 
 
 
122 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05290  diacylglycerol kinase  58.47 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0513  diacylglycerol kinase  57.14 
 
 
121 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0732  diacylglycerol kinase  57.14 
 
 
121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001810  diacylglycerol kinase  64.96 
 
 
135 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3525  diacylglycerol kinase  52.99 
 
 
121 aa  124  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0653  diacylglycerol kinase  52.63 
 
 
118 aa  124  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.815774  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4493  diacylglycerol kinase  50 
 
 
122 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4630  diacylglycerol kinase  50 
 
 
122 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.312152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4578  diacylglycerol kinase  50 
 
 
122 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4579  diacylglycerol kinase  50 
 
 
122 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795309  normal  0.304118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4428  diacylglycerol kinase  50 
 
 
122 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000195927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2480  diacylglycerol kinase  54.78 
 
 
128 aa  121  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927922  normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0246  diacylglycerol kinase  49.15 
 
 
122 aa  120  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105689  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00663  diacylglycerol kinase  54.17 
 
 
134 aa  120  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3399  diacylglycerol kinase  50.43 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1317  diacylglycerol kinase  53.45 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4461  diacylglycerol kinase  51.33 
 
 
122 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0678  diacylglycerol kinase  50 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17675  diacylglycerol kinase  51.24 
 
 
123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1538  diacylglycerol kinase  51.24 
 
 
123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02047  Diacylglycerol kinase  53.57 
 
 
117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0216471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3643  diacylglycerol kinase  58.26 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0557475  normal  0.215747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1183  diacylglycerol kinase  47.9 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2929  diacylglycerol kinase  47.97 
 
 
123 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19800  Prokaryotic diacylglycerol kinase  53.04 
 
 
127 aa  114  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000582  diacylglycerol kinase  57.02 
 
 
118 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.300215  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0193  diacylglycerol kinase  51.72 
 
 
118 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2898  diacylglycerol kinase  47.41 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2973  diacylglycerol kinase  57.39 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2290  diacylglycerol kinase  48.31 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.213941  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3861  diacylglycerol kinase  48.33 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.957403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3771  diacylglycerol kinase  48.33 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.886754  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1299  diacylglycerol kinase  48.33 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4023  diacylglycerol kinase  47.06 
 
 
120 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2029  diacylglycerol kinase  47.9 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0748724  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1636  diacylglycerol kinase  46.09 
 
 
121 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4081  diacylglycerol kinase  46.09 
 
 
121 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1238  diacylglycerol kinase  46.09 
 
 
121 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000273829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2363  diacylglycerol kinase  48.28 
 
 
135 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1251  diacylglycerol kinase  47.86 
 
 
124 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1712  diacylglycerol kinase  47.83 
 
 
137 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554217  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0655  diacylglycerol kinase  47.86 
 
 
131 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655442  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1587  diacylglycerol kinase  45 
 
 
134 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.882311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4026  diacylglycerol kinase  46.22 
 
 
121 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1506  diacylglycerol kinase  49.57 
 
 
126 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.72408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2085  diacylglycerol kinase transmembrane protein  52.14 
 
 
153 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717533  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1451  diacylglycerol kinase  49.57 
 
 
126 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1599  diacylglycerol kinase  53.51 
 
 
126 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0788  diacylglycerol kinase  43.1 
 
 
122 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267959 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2236  diacylglycerol kinase  52.1 
 
 
154 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0048  diacylglycerol kinase  47.46 
 
 
120 aa  100  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1980  diacylglycerol kinase  50.86 
 
 
118 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1913  diacylglycerol kinase  51.26 
 
 
154 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0939  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
161 aa  99.4  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04654  diacylglycerol kinase  47.86 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0592128  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1856  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
181 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1038  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
181 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2312  diacylglycerol kinase  45.22 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2704  diacylglycerol kinase  44.07 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1106  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4234  diacylglycerol kinase  51.61 
 
 
120 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000825064  hitchhiker  0.000000879187 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0760  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1273  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
181 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.924748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0389  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1411  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
181 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.078925  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0318  diacylglycerol kinase  39.47 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1725  diacylglycerol kinase  51.72 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1266  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
181 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1163  diacylglycerol kinase  44.25 
 
 
116 aa  97.4  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3238  diacylglycerol kinase  49.58 
 
 
176 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1385  diacylglycerol kinase  47.06 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2262  diacylglycerol kinase  47.41 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1321  diacylglycerol kinase  49.58 
 
 
212 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.799291  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3117  diacylglycerol kinase  46.22 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00354589  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0903  diacylglycerol kinase  50.42 
 
 
144 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>