78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1559 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1559  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000960005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1880  hypothetical protein  80.49 
 
 		 204 aa  350  8.999999999999999e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2706  hypothetical protein  79.51 
 
 		 204 aa  344  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0532823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2539  hypothetical protein  77.56 
 
 		 205 aa  341  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1602  hypothetical protein  78.05 
 
 		 205 aa  338  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00444605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1746  hypothetical protein  77.56 
 
 		 205 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1677  hypothetical protein  77.56 
 
 		 205 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260376  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2472  hypothetical protein  77.07 
 
 		 205 aa  334  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000127559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1872  hypothetical protein  76.59 
 
 		 205 aa  334  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000337406  hitchhiker  0.00000947972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2479  hypothetical protein  76.59 
 
 		 205 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000487251  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2592  hypothetical protein  76.59 
 
 		 205 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00225749  normal  0.0485502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2234  hypothetical protein  77.07 
 
 		 205 aa  333  9e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2634  hypothetical protein  76.1 
 
 		 205 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2261  hypothetical protein  77.27 
 
 		 210 aa  323  8.000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2063  hypothetical protein  73.23 
 
 		 204 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000421007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1827  hypothetical protein  71.36 
 
 		 211 aa  296  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02369  hypothetical protein  51.24 
 
 		 208 aa  210  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0518841  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2196  hypothetical protein  49 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2901  hypothetical protein  49.27 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0645  hypothetical protein  46.5 
 
 		 205 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003856  hypothetical protein  46 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.489271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01823  hypothetical protein  46 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2380  hypothetical protein  45.73 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.386361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0962  hypothetical protein  47.26 
 
 		 209 aa  187  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2852  hypothetical protein  43.9 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.954826 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1719  hypothetical protein  43.9 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1611  hypothetical protein  43.9 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2153  hypothetical protein  42.23 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0117642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1868  hypothetical protein  42.72 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1594  hypothetical protein  43.88 
 
 		 203 aa  161  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1993  hypothetical protein  41.75 
 
 		 213 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.934433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2471  hypothetical protein  41.75 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01138  hypothetical protein  41.75 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1295  hypothetical protein  41.75 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1252  hypothetical protein  41.75 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2515  protein of unknown function DUF489  41.75 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0030119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01130  hypothetical protein  41.75 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2133  hypothetical protein  40.78 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0109581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2021  hypothetical protein  40.39 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.265871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1951  hypothetical protein  40.78 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1350  hypothetical protein  40.78 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1334  hypothetical protein  40.78 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1593  hypothetical protein  41.26 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1763  hypothetical protein  39.02 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.173363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1310  hypothetical protein  41.26 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1312  hypothetical protein  41.29 
 
 		 215 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2064  hypothetical protein  37.86 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.890726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1645  hypothetical protein  39.81 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1941  hypothetical protein  40.29 
 
 		 210 aa  151  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2041  hypothetical protein  40.8 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1267  protein of unknown function DUF489  36.6 
 
 		 209 aa  140  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4015  hypothetical protein  37.82 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1818  hypothetical protein  37.82 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.112732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3359  hypothetical protein  38.46 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2400  hypothetical protein  36.92 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00786814  normal  0.0777088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30140  hypothetical protein  38 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3620  hypothetical protein  37.31 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28370  hypothetical protein  37.24 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3419  hypothetical protein  37.31 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.915655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3191  hypothetical protein  37.44 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.140905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3597  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2580  hypothetical protein  38.92 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1918  hypothetical protein  35.61 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3266  hypothetical protein  33 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1676  hypothetical protein  34.72 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1098  hypothetical protein  31.82 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06141  hypothetical protein  32.99 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01025  hypothetical protein  32.99 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0201  hypothetical protein  33 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0760616  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1843  hypothetical protein  36.98 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1452  hypothetical protein  31.66 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2445  hypothetical protein  34.54 
 
 		 214 aa  114  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0695  hypothetical protein  30.39 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.596389  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0782  hypothetical protein  30.88 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1042  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0923  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1949  protein of unknown function DUF489  29.35 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1405  hypothetical protein  30.69 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>