More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1522 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  76.85 
 
 		 727 aa  1150    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  55.74 
 
 		 689 aa  801    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  52.83 
 
 		 688 aa  766    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  47.07 
 
 		 745 aa  675    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  78.6 
 
 		 729 aa  1133    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  52.83 
 
 		 688 aa  767    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  80.14 
 
 		 718 aa  1187    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  52.56 
 
 		 695 aa  764    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  50.87 
 
 		 703 aa  756    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  79.64 
 
 		 727 aa  1149    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  78.06 
 
 		 727 aa  1132    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  77.89 
 
 		 727 aa  1149    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  78.88 
 
 		 718 aa  1174    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  78.1 
 
 		 714 aa  1162    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  77.52 
 
 		 726 aa  1147    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  73.25 
 
 		 718 aa  1075    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  78.2 
 
 		 727 aa  1134    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  77.09 
 
 		 727 aa  1137    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  53.66 
 
 		 689 aa  760    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  55.42 
 
 		 688 aa  790    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  100 
 
 		 696 aa  1439    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  49.78 
 
 		 685 aa  687    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  77.23 
 
 		 727 aa  1137    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  49.78 
 
 		 682 aa  668    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  48.29 
 
 		 708 aa  647    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  47.77 
 
 		 719 aa  623  1e-177  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  47.04 
 
 		 713 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  47.47 
 
 		 685 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  46.29 
 
 		 719 aa  621  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  44.6 
 
 		 724 aa  618  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  45.71 
 
 		 730 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  45.56 
 
 		 700 aa  608  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  44.92 
 
 		 723 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  46.41 
 
 		 701 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  46.42 
 
 		 677 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  45.35 
 
 		 670 aa  586  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  44.63 
 
 		 679 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  43.56 
 
 		 710 aa  581  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  43.79 
 
 		 703 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  44.96 
 
 		 719 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  41.94 
 
 		 719 aa  568  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  41.59 
 
 		 685 aa  543  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  44.66 
 
 		 711 aa  541  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  39.94 
 
 		 719 aa  525  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  40.48 
 
 		 707 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  39.62 
 
 		 714 aa  502  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  38.15 
 
 		 726 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  39.74 
 
 		 713 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.12 
 
 		 1283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.86 
 
 		 740 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  35.81 
 
 		 690 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  37.25 
 
 		 690 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  35.68 
 
 		 703 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  36.1 
 
 		 697 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  35.34 
 
 		 702 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  34.58 
 
 		 704 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  34.32 
 
 		 666 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  34 
 
 		 709 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  34.57 
 
 		 717 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  35.89 
 
 		 723 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  34.01 
 
 		 692 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  35.37 
 
 		 742 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  31.59 
 
 		 705 aa  350  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  28.86 
 
 		 734 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00580  Prolyl endopeptidase, putative  29.3 
 
 		 803 aa  283  9e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  30.08 
 
 		 733 aa  282  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  27.29 
 
 		 705 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  28.22 
 
 		 704 aa  278  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00350  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 		 811 aa  277  5e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  30.21 
 
 		 686 aa  275  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  30.43 
 
 		 614 aa  271  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  27.8 
 
 		 688 aa  264  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  28.32 
 
 		 686 aa  261  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  27.67 
 
 		 705 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  26.22 
 
 		 730 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  30.3 
 
 		 696 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  29.77 
 
 		 697 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  27.78 
 
 		 732 aa  249  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  27.15 
 
 		 682 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  29.1 
 
 		 686 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  26.44 
 
 		 721 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  27.04 
 
 		 718 aa  238  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  27.87 
 
 		 700 aa  237  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  28.77 
 
 		 702 aa  237  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  26.45 
 
 		 690 aa  236  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  28.7 
 
 		 671 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  33.19 
 
 		 697 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  29.54 
 
 		 696 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  27.82 
 
 		 708 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  29.24 
 
 		 706 aa  235  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  34.73 
 
 		 710 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  28.13 
 
 		 696 aa  233  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  29.43 
 
 		 686 aa  233  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  28.41 
 
 		 719 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  29.39 
 
 		 701 aa  232  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  27.87 
 
 		 715 aa  232  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  29.09 
 
 		 706 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  28.66 
 
 		 697 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.12 
 
 		 697 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  29.09 
 
 		 706 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>