73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1515 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  78.2 
 
 		 445 aa  653    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  85.19 
 
 		 439 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  77.5 
 
 		 442 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  85.42 
 
 		 439 aa  732    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  85.65 
 
 		 439 aa  732    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  83.37 
 
 		 440 aa  726    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  86.56 
 
 		 439 aa  729    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  86.56 
 
 		 439 aa  729    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 439 aa  862    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  84.28 
 
 		 439 aa  697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  83.6 
 
 		 439 aa  711    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  86.56 
 
 		 439 aa  729    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  85.42 
 
 		 439 aa  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  89.52 
 
 		 439 aa  744    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  86.56 
 
 		 439 aa  729    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  83.6 
 
 		 439 aa  737    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  66.59 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  66.44 
 
 		 441 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  66.04 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  65.61 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  65.62 
 
 		 446 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  61.14 
 
 		 440 aa  528  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  65 
 
 		 440 aa  531  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  60.27 
 
 		 448 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  57.02 
 
 		 452 aa  491  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  56.82 
 
 		 439 aa  485  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  56.59 
 
 		 439 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  56.14 
 
 		 439 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  56.14 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  56.14 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  54.63 
 
 		 453 aa  475  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  54.43 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  56.59 
 
 		 439 aa  471  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  56.36 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  56.82 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  56.36 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  55.68 
 
 		 439 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  56.14 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  58.73 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  58.73 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  56.82 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  59.55 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  60 
 
 		 439 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  57.47 
 
 		 439 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  57.05 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  57.5 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  47.43 
 
 		 448 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  49.89 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  49.89 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  50.57 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  46.9 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  45.27 
 
 		 432 aa  363  3e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  48.72 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  46.61 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  44.75 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  44.52 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  45.02 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  44.98 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  44.22 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  42.6 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  42.86 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  40.66 
 
 		 450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.87 
 
 		 571 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  28.87 
 
 		 571 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  28.91 
 
 		 521 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  26.13 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  20.98 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  32.91 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  31.14 
 
 		 533 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  32.93 
 
 		 525 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  32.93 
 
 		 525 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  33.09 
 
 		 534 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  34.34 
 
 		 541 aa  43.5  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>