27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1505 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1505  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250222  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1601  hypothetical protein  76.39 
 
 
235 aa  374  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00766974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1835  hypothetical protein  79.82 
 
 
246 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1713  hypothetical protein  74.25 
 
 
246 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409323  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1691  hypothetical protein  73.82 
 
 
246 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666754  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1676  hypothetical protein  73.39 
 
 
246 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0089383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2666  hypothetical protein  73.39 
 
 
246 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0398844  normal  0.0175894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2484  hypothetical protein  73.93 
 
 
234 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00768413  normal  0.204356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2576  hypothetical protein  73.08 
 
 
234 aa  360  8e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000189024  normal  0.179906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2414  hypothetical protein  73.5 
 
 
234 aa  360  8e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00806149  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1565  hypothetical protein  73.08 
 
 
234 aa  357  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1597  hypothetical protein  71.37 
 
 
233 aa  355  3e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.321672  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2794  hypothetical protein  71.37 
 
 
234 aa  353  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2037  hypothetical protein  71.79 
 
 
232 aa  347  9e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.81321e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2753  hypothetical protein  74.36 
 
 
234 aa  343  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15175  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0530  hypothetical protein  62.66 
 
 
234 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07109  hypothetical protein  64.5 
 
 
235 aa  320  2e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0241  hypothetical protein  63.52 
 
 
241 aa  317  8e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1227  hypothetical protein  64.07 
 
 
234 aa  317  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.04269e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4969  hypothetical protein  66.06 
 
 
236 aa  315  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.349038  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001025  hypothetical protein  61.8 
 
 
235 aa  313  2e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2105  hypothetical protein  65.24 
 
 
234 aa  301  5e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.796531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3913  hypothetical protein  60.94 
 
 
234 aa  296  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  3.17623e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1445  hypothetical protein  59.46 
 
 
240 aa  282  4e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1017  hypothetical protein  50.85 
 
 
236 aa  219  2e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1501  hypothetical protein  49.78 
 
 
236 aa  192  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  21.57 
 
 
199 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.10329e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>