86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1504 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
143 aa  291  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  64.57 
 
 
131 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  61.11 
 
 
126 aa  155  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  51.47 
 
 
142 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  53.04 
 
 
179 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  45.69 
 
 
131 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  48.62 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  43.97 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  43.97 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  43.4 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  41.88 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  41.88 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  41.88 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  39.32 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  41.88 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  41.23 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  40.35 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  40.35 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  40.35 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  40.35 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  40.35 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  40.35 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  40.35 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  39.47 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  40.35 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  37.8 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  41.67 
 
 
166 aa  77  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  41.84 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  39.8 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  39.8 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  39.8 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  42.39 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  32.46 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  35.04 
 
 
147 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  33.33 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  36.61 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  34.19 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  37.25 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  39.8 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  36.79 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  35 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
153 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  27.03 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  26.79 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  38.6 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  31.65 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  30.67 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  44.9 
 
 
173 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  33.87 
 
 
178 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2961  streptothricin acetyltransferase  28 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  28 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3185  streptothricin acetyltransferase  28 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.95857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  36.51 
 
 
170 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  25.86 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3197  streptothricin acetyltransferase, putative  30.38 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  36.67 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5685  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
184 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  hitchhiker  0.00928035 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2964  acetyltransferase, GNAT family  25.66 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0548  acetyltransferase  27.55 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.995158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33160  acetyltransferase (GNAT) family protein  23.36 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0204184  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2046  putative acetyltransferase (GNAT) family protein  30.17 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
183 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0626  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  32.47 
 
 
152 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
151 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>