96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1470 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  67.23 
 
 		 594 aa  865    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  64.32 
 
 		 595 aa  820    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  100 
 
 		 595 aa  1234    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  60.43 
 
 		 594 aa  736    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  65.38 
 
 		 596 aa  840    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  63.15 
 
 		 592 aa  807    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  60.54 
 
 		 596 aa  755    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  65.38 
 
 		 596 aa  840    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  65.38 
 
 		 596 aa  840    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  64.32 
 
 		 595 aa  820    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  62.05 
 
 		 604 aa  776    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  64.2 
 
 		 594 aa  824    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  64.15 
 
 		 595 aa  819    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  64.32 
 
 		 595 aa  821    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  64.88 
 
 		 596 aa  828    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  67.28 
 
 		 595 aa  862    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  34.04 
 
 		 602 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  33.44 
 
 		 602 aa  343  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  34.05 
 
 		 600 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  32.52 
 
 		 601 aa  335  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  31.92 
 
 		 598 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  31.92 
 
 		 598 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  31.92 
 
 		 598 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  29.62 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  29.62 
 
 		 586 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  29.46 
 
 		 586 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  29.46 
 
 		 586 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  29.46 
 
 		 586 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  29.46 
 
 		 586 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  29.46 
 
 		 586 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  29.46 
 
 		 586 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  29.46 
 
 		 586 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  30.56 
 
 		 586 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  30.11 
 
 		 595 aa  276  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  29.3 
 
 		 586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  29.3 
 
 		 586 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  29.3 
 
 		 586 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  29.3 
 
 		 586 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  29.3 
 
 		 586 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  30.02 
 
 		 593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  29.8 
 
 		 590 aa  257  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  30.73 
 
 		 580 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  29.51 
 
 		 590 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  29.18 
 
 		 582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  29.82 
 
 		 582 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  29.84 
 
 		 615 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  27.61 
 
 		 622 aa  210  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  26.19 
 
 		 617 aa  206  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  26.19 
 
 		 617 aa  206  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  26.55 
 
 		 600 aa  206  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  26.9 
 
 		 613 aa  196  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  24.74 
 
 		 647 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  25 
 
 		 638 aa  178  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  25.86 
 
 		 607 aa  177  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  25.37 
 
 		 611 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  26.41 
 
 		 609 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  24.87 
 
 		 637 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  27.5 
 
 		 607 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  24.71 
 
 		 637 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  26.67 
 
 		 635 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  26.67 
 
 		 638 aa  164  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  30.23 
 
 		 509 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  27.03 
 
 		 625 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  34.07 
 
 		 586 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  28.49 
 
 		 508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  27.58 
 
 		 624 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  24.31 
 
 		 642 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  25.52 
 
 		 641 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  23.72 
 
 		 614 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  23.34 
 
 		 621 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  20.74 
 
 		 630 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  23.2 
 
 		 642 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  21.65 
 
 		 621 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  21.84 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  22.67 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  22.4 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  22.4 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  22.4 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  22.13 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  22.4 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  22.67 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  22.13 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  22.4 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  22.4 
 
 		 642 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  23.98 
 
 		 639 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  23.98 
 
 		 639 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  23.98 
 
 		 639 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  23.98 
 
 		 639 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  23.98 
 
 		 639 aa  52.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  23.98 
 
 		 639 aa  52  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  22.98 
 
 		 639 aa  50.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  23.68 
 
 		 639 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  23.68 
 
 		 639 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  24.4 
 
 		 639 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  23.19 
 
 		 554 aa  44.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0533  sulfatase  22.78 
 
 		 486 aa  43.9  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.270273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>