105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1431 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  303  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  70.29 
 
 		 135 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  72.36 
 
 		 131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  58.7 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  63.16 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  58 
 
 		 282 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  47.15 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  50 
 
 		 265 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  43.55 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  45.69 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  45.69 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  47.62 
 
 		 262 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  47.62 
 
 		 262 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  43.22 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  43.22 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  43.22 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  48.6 
 
 		 278 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  43.22 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  44.14 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  46.83 
 
 		 270 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  46.03 
 
 		 269 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  46.83 
 
 		 267 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  47.12 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  45.24 
 
 		 173 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  39.83 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  36.97 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  27.94 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  33.63 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  29.58 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  31.78 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  28.43 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  32.76 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  33 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  30.28 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  33 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  30.85 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  30.48 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  30.25 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  27.66 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  27.66 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  30.15 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  26.4 
 
 		 199 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  29.31 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  33.04 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  30.69 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  32.17 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  33.68 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  31.58 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  29.23 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  25.19 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  27.55 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  34.67 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  30.77 
 
 		 223 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  27.27 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  31.87 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  30.48 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  28.26 
 
 		 115 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  28.87 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  27.03 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  23.81 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  28.04 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2505  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  23.81 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  27.18 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  27.64 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  26.56 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  27.18 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  26.6 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  31.46 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  28.28 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  28.18 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  28.18 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  28.42 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  24.37 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  27.34 
 
 		 195 aa  43.5  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  26.36 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  28.72 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  27.27 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  30.65 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  23.45 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  23.45 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  27.17 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  25 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  27.59 
 
 		 159 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  26.5 
 
 		 144 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  25.58 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3570  hypothetical protein  26.8 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  27.27 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3636  protein of unknown function DUF583  26.8 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.641699  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  25.84 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>