More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1414 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1414  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 		 958 aa  69.7  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  30.94 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.96 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  34.43 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  32.04 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.67 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 1250 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.67 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.14 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  41.05 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.89 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.37 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.28 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  40.43 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  35.05 
 
 		 102 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.28 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 		 1177 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 		 1177 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2673  putative glycosyl transferase  32.63 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  40.43 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.29 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  42.55 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  39.78 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  30.6 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  31.62 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  35.29 
 
 		 1157 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 780 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.66 
 
 		 957 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.84 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  30.77 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  30.84 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.33 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.61 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 672 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  39.18 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  30.05 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  33.67 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  33.67 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.04 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 597 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  33.67 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  33.67 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  31.96 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  25.75 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.18 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.71 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  31.96 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27900  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  37.14 
 
 		 1157 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 		 609 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1433  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.23 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 		 553 aa  55.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 		 528 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>