More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1393 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1393  FlhB domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  243  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372355  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  73.27 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1353  FlhB domain-containing protein  71.28 
 
 		 99 aa  150  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  70.3 
 
 		 103 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  70.3 
 
 		 103 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  71.13 
 
 		 104 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  71.88 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  71.88 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  69 
 
 		 103 aa  148  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  71.88 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  70.21 
 
 		 104 aa  147  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  72.34 
 
 		 102 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3039  FlhB domain-containing protein  67.68 
 
 		 111 aa  147  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505506 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  70.83 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  67.37 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2270  FlhB domain-containing protein  63.44 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.381312  normal  0.112647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3258  FlhB domain-containing protein  49.52 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  45.74 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03076  uncharacterized C-terminal FlhB domain-containing protein  44.55 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1575  FlhB domain-containing protein  49.43 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4329  FlhB domain-containing protein  48.94 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1538  flagellar protein FhlB-like protein  49.43 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3395  FlhB domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3637  FlhB domain protein  50 
 
 		 107 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  44.83 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2793  flagellar protein FhlB-like protein  47.25 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.231466 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  47.56 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3854  flagellar biosynthetic FlhB domain-containing protein  47.19 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119948  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  47.56 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1808  flagellar protein FhlB-like protein  41.51 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45410  FlhB domain-containing protein  49.4 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1814  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  41.11 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0287709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2361  flagellar biosynthesis protein  50 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2404  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  38.71 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  50.68 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3898  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  44.44 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1962  flagellar protein FhlB cytoplasmic domain-containing protein  45.57 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3320  FlhB domain protein  46.15 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  50.62 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  43.21 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3161  FlhB domain-containing protein  45 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0369  FlhB domain-containing protein  46.25 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3104  putative flagellar protein FhlB  42.53 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  52.63 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2970  putative flagellar protein FhlB  41.38 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0147408  normal  0.125746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0778  flagellar biosynthetic protein  44.58 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0719  flagellar biosynthesis protein  37.89 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0524995  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5095  putative flagellar protein  45.98 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.37 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2893  flagellar related protein  38.82 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2369  flagellar protein FhlB-like protein  38.95 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0429  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  39.02 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.904356  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1980  putative flagellar biosynthetic protein  41.67 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5258  putative flagellar protein  42.11 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0170106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  43.21 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  45.33 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3056  putative flagellar protein FhlB  41.77 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1105  hypothetical protein  43.53 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.372697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  42.05 
 
 		 95 aa  67  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0227  putative flagellar biosynthesis protein  40.23 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0239  putative flagellar biosynthesis protein  40.23 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2137  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  41.46 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.406507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0421  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  40.23 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0303064  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3078  putative flagellar protein FhlB  39.76 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  42.86 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2951  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  41.77 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0205  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  40.48 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1351  flagellar protein with uncharacterized cytoplasmic FhlB domain-like protein  46.15 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1864  flagellar protein FhlB-like protein  43.75 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.989751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2445  putative flagellar protein FhlB  39.76 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.735918  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3059  putative flagellar protein FhlB  39.76 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6408  putative flagellar protein FhlB  39.76 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.15037 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1836  flagellar protein FhlB-like cytoplasmic domain-containing protein  34.82 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000219189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  41.77 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  44.16 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  40.51 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2399  flagellar protein FhlB-like protein  40.43 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.303724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3417  FlhB domain-containing protein  39.24 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1596  flagellar protein FhlB  37.97 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3034  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  38.27 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  41.67 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2827  hypothetical protein  39.33 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  42.5 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  41.25 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  39.08 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2926  flagellar biosynthetic protein FlhB  40 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  41.46 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0171  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.76 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.35881 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  39.08 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  39.08 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3395  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  41.33 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3286  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  41.33 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831701  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1343  flagellar biosynthetic protein-like protein  38.27 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.58 
 
 		 366 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3765  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.93 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.943439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4161  flagellar biosynthesis protein  34.38 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1547  flagellar protein FhlB-like protein  41.56 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.178027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0759  flagellar biosynthesis  38.64 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>