88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1375 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  100 
 
 		 125 aa  246  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  71.43 
 
 		 125 aa  157  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  71.29 
 
 		 136 aa  151  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  59.02 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  54.55 
 
 		 133 aa  137  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  59.63 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1370  flagellar biosynthesis protein FliO  61.29 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1446  flagellar biosynthesis protein FliO  67.33 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00843701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2917  flagellar biosynthesis protein FliO  67.33 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2927  flagellar biosynthesis protein FliO  67.33 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3059  flagellar biosynthesis protein FliO  60.18 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.400554  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2567  flagellar biosynthesis protein, FliO  56.45 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1351  flagellar biosynthesis protein, FliO  57.02 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00422095  normal  0.37669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1358  flagellar biosynthesis protein, FliO  59.32 
 
 		 135 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1291  flagellar biosynthesis protein, FliO  59.32 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3219  flagellar protein FliO  66.23 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.43 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  43.82 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  41.57 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  40.96 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.13 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  34.58 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  34.19 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.09 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  36.96 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.48 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  35.87 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  34.38 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.6 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2299  polar flagellar assembly protein FliO  32.99 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  37.5 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  34.19 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  36.54 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  36.54 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  36.54 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  36.54 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  36.54 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  40.58 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1167  flagellar biosynthetic protein FliO  34.91 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481561  normal  0.0745006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  39.13 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02878  polar flagellar assembly protein FliO  27.66 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.87 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  32.29 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  36.59 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  33.63 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  36.14 
 
 		 178 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.25 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  29.91 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1706  flagellar protein FliO  44.09 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.25 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.68 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  29.36 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.68 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  36.49 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  39.13 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  38.98 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  39.13 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  39.13 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  37.68 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  39.13 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  39.13 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  39.13 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  39.13 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  37.68 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  36.23 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  34.44 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1330  flagellar biosynthesis protein FliO  35.37 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  37.97 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  37.97 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  32.56 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  39.24 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.25 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1094  flagellar protein FliO  30 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140384  normal  0.933798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  27.52 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  32.18 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.68 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0977  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.14 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.40867  normal  0.0426342 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1754  flagellar protein fliO  33.33 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  29.27 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3909  putative flagellar biogenesis protein  30.28 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1754  flagellar protein fliO  33.33 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0583  flagellar biosynthesis protein FliO  31.07 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.71 
 
 		 144 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  37.04 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  30.49 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0500  hypothetical protein  21.57 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.66012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1167  flagellar biogenesis protein FliO  26.04 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0152  flagellar biosynthesis protein FliO  32.05 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>