250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1367 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  91.12 
 
 		 349 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  100 
 
 		 347 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  90.8 
 
 		 348 aa  621  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  90.8 
 
 		 348 aa  621  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  90.52 
 
 		 348 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  90.52 
 
 		 348 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  89.63 
 
 		 350 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  89.63 
 
 		 350 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  89.63 
 
 		 350 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  90.26 
 
 		 349 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  89.63 
 
 		 350 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  91.32 
 
 		 348 aa  608  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  92.22 
 
 		 349 aa  608  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  86.49 
 
 		 348 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  90.42 
 
 		 351 aa  598  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  87.32 
 
 		 345 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  75.15 
 
 		 346 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  77.54 
 
 		 351 aa  498  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  72.27 
 
 		 351 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  69.25 
 
 		 350 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  71.13 
 
 		 351 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  69.97 
 
 		 351 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  71.26 
 
 		 338 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  58.05 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  57.75 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  58.05 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  57.45 
 
 		 339 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  55.42 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  55.42 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  56.53 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  56.23 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  54.71 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  57.28 
 
 		 347 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  56.02 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  53.85 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  55.12 
 
 		 339 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  58.28 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  51.05 
 
 		 334 aa  355  5.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  51.2 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  51.2 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  50.3 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  48.04 
 
 		 337 aa  338  8e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  50.61 
 
 		 334 aa  335  9e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  51.03 
 
 		 346 aa  325  6e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  48.62 
 
 		 334 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  47.37 
 
 		 329 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  44.98 
 
 		 329 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  44.98 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  49.55 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3110  flagellar motor switch protein G  45.57 
 
 		 331 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2976  flagellar motor switch protein G  45.57 
 
 		 331 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1879  flagellar motor switch protein FliG  48.61 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246079  normal  0.586274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3062  flagellar motor switch protein G  44.95 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  44.55 
 
 		 333 aa  308  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0165  flagellar motor switch protein G  45.57 
 
 		 331 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3280  flagellar motor switch protein G  45.26 
 
 		 331 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0416  flagellar motor switch protein G  45.26 
 
 		 331 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0199  flagellar motor switch protein G  44.95 
 
 		 331 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2945  flagellar motor switch protein G  45.26 
 
 		 331 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0221  flagellar motor switch protein G  45.26 
 
 		 331 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0619042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0233  flagellar motor switch protein G  45.26 
 
 		 331 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631477  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3771  flagellar motor switch protein G  45.57 
 
 		 331 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  46.36 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2451  flagellar motor switch protein G  45.26 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00544517  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3065  flagellar motor switch protein G  45.26 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00336873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2143  flagellar motor switch protein G  44.95 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3401  flagellar motor switch protein G  44.95 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3084  flagellar motor switch protein G  45.26 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4730  flagellar motor switch protein G  45.57 
 
 		 330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.231859  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3653  flagellar motor switch protein G  45.57 
 
 		 330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.552774 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0391  flagellar motor switch protein G  46.08 
 
 		 330 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6414  flagellar motor switch protein G  44.95 
 
 		 331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  45.15 
 
 		 331 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  43.43 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  46.18 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2900  flagellar motor switch protein FliG  47.69 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  45.45 
 
 		 331 aa  295  8e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1346  flagellar motor switch protein FliG  45.12 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  46.25 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  44.55 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  42.6 
 
 		 340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  42.6 
 
 		 340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1541  flagellar motor switch protein G  46.44 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1642  flagellar motor switch protein FliG  42.3 
 
 		 339 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.049908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1575  flagellar motor switch protein G  44.85 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  44.21 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1441  flagellar motor switch protein FliG  43.28 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2576  flagellar motor switch protein G  44.89 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0189022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1890  flagellar motor switch protein G  44.58 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2291  flagellar motor switch protein G  43.96 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.60642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2013  flagellar motor switch protein G  43.96 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2392  flagellar motor switch protein G  43.96 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178254  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5098  flagellar motor switch protein G  42.55 
 
 		 337 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699284  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  42.41 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1956  flagellar motor switch protein FliG  42.11 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2948  flagellar motor switch protein G  43.34 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2530  flagellar motor switch protein G  43.03 
 
 		 333 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1149  flagellar motor switch protein G  42.3 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2133  flagellar motor switch protein G  42.3 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184117 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2186  flagellar motor switch protein G  42.3 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.296587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>