242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1355 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  76.52 
 
 		 396 aa  634    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  79.04 
 
 		 396 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 		 396 aa  798    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  68.98 
 
 		 403 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  67.49 
 
 		 403 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  67.74 
 
 		 403 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  68.24 
 
 		 403 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  67.74 
 
 		 403 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  67.74 
 
 		 403 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  67.49 
 
 		 403 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  65.09 
 
 		 401 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  61.85 
 
 		 400 aa  508  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  61.1 
 
 		 401 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  58.75 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  56.72 
 
 		 402 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  56.47 
 
 		 402 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  35.29 
 
 		 406 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  31.85 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  30.9 
 
 		 411 aa  189  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  31.84 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  32.52 
 
 		 408 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  30.46 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  29.82 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  31.34 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  30.4 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  29.7 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  28.14 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  32.09 
 
 		 398 aa  169  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  30.2 
 
 		 403 aa  166  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  30.17 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  29.33 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  33.81 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.37 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  29.61 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  30.17 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  29.17 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  29.58 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  29.98 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  31.08 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  28.12 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  28.12 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  28.12 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  28.12 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  28.12 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  28.12 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  28.5 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  27.71 
 
 		 410 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  29.24 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  28.99 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  27.05 
 
 		 410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  28.06 
 
 		 411 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  28.06 
 
 		 411 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  28.13 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  29.71 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  27.18 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  28.23 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  28.61 
 
 		 413 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  25.79 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.74 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  25.37 
 
 		 399 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  26.81 
 
 		 428 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  40.49 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  37.16 
 
 		 562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  25.54 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  29.46 
 
 		 523 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  25.65 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  30.43 
 
 		 302 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  36.61 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  36.61 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  36.61 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  36.61 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  36.61 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  31.32 
 
 		 530 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  26.16 
 
 		 410 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  36.41 
 
 		 317 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  34.39 
 
 		 532 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  36.32 
 
 		 521 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  36.41 
 
 		 317 aa  106  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  34.97 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  34.97 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  34.97 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  34.97 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  35.87 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  32.13 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  30.56 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  32.2 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  38.1 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  31.5 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  31.67 
 
 		 530 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  34.29 
 
 		 317 aa  103  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  32.86 
 
 		 521 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  35.26 
 
 		 304 aa  99.4  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  30.25 
 
 		 299 aa  99.4  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  30.45 
 
 		 524 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  31.64 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  34.93 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  30.47 
 
 		 305 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>