253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1354 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  75.08 
 
 		 637 aa  982    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  71.88 
 
 		 640 aa  953    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  73.01 
 
 		 641 aa  956    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  73.01 
 
 		 641 aa  955    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 638 aa  1282    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  78.53 
 
 		 638 aa  1016    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  68.91 
 
 		 639 aa  900    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  73.17 
 
 		 641 aa  962    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  73.32 
 
 		 641 aa  962    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  69.83 
 
 		 642 aa  903    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  73.95 
 
 		 641 aa  963    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  71.47 
 
 		 638 aa  907    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  72.85 
 
 		 641 aa  951    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  72.85 
 
 		 641 aa  956    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  73.17 
 
 		 641 aa  959    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  71.43 
 
 		 386 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  35.02 
 
 		 665 aa  363  8e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2329  flagellar hook-associated protein FlgK  34.27 
 
 		 626 aa  340  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004164  flagellar hook-associated protein FlgK  32.78 
 
 		 646 aa  324  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01297  flagellar hook-associated protein FlgK  32.2 
 
 		 637 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1783  flagellar hook-associated protein FlgK  32.25 
 
 		 624 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  34.75 
 
 		 682 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  32.05 
 
 		 676 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 		 649 aa  280  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  32.32 
 
 		 647 aa  277  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  32.55 
 
 		 681 aa  277  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.33 
 
 		 649 aa  276  8e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  30.59 
 
 		 645 aa  267  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  31.38 
 
 		 624 aa  261  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  31.38 
 
 		 624 aa  261  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  30.78 
 
 		 681 aa  256  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  32.28 
 
 		 645 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  31.96 
 
 		 631 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  32.28 
 
 		 645 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  30.31 
 
 		 682 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  31.88 
 
 		 683 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  31.34 
 
 		 626 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  30.04 
 
 		 680 aa  251  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  33.85 
 
 		 629 aa  251  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  31.47 
 
 		 642 aa  250  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  31.18 
 
 		 637 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  30.61 
 
 		 680 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  31.05 
 
 		 680 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  27.6 
 
 		 688 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  31.51 
 
 		 638 aa  246  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  30.96 
 
 		 686 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  29.94 
 
 		 686 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  30.54 
 
 		 640 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  30.83 
 
 		 631 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  28.29 
 
 		 644 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  28.35 
 
 		 709 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  29.09 
 
 		 652 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  29.39 
 
 		 667 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  29.54 
 
 		 667 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  29.54 
 
 		 714 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  29.54 
 
 		 667 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  29.54 
 
 		 667 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  29.54 
 
 		 667 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  29.54 
 
 		 667 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  29.54 
 
 		 667 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  30.63 
 
 		 659 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  28.49 
 
 		 657 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  29.03 
 
 		 640 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  28.43 
 
 		 683 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  29.95 
 
 		 641 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  29.82 
 
 		 640 aa  212  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  30.38 
 
 		 643 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  30.38 
 
 		 643 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  30.38 
 
 		 643 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 695 aa  211  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  31.04 
 
 		 660 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  29.29 
 
 		 657 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 		 685 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 		 642 aa  193  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  27.81 
 
 		 657 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  27.98 
 
 		 653 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  30.78 
 
 		 665 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  26.02 
 
 		 672 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  25.64 
 
 		 691 aa  183  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  26.78 
 
 		 920 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  26.22 
 
 		 658 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  30.01 
 
 		 665 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  30.65 
 
 		 548 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  29.19 
 
 		 630 aa  177  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  29.44 
 
 		 546 aa  177  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  25.29 
 
 		 658 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  30.46 
 
 		 554 aa  174  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  30.46 
 
 		 554 aa  174  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  30.46 
 
 		 554 aa  174  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  26.26 
 
 		 642 aa  173  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 		 547 aa  171  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  28.6 
 
 		 547 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  28.6 
 
 		 547 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.6 
 
 		 547 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  28.6 
 
 		 547 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  28.51 
 
 		 539 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  28.6 
 
 		 547 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.6 
 
 		 547 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  28.35 
 
 		 547 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>