56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1336 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  889    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  57.91 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  59.21 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  56.76 
 
 		 441 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  56.08 
 
 		 442 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  55.86 
 
 		 442 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  43.85 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  44.6 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  44.6 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  43.33 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  44.44 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  34.51 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  32.49 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  30.36 
 
 		 629 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  29.06 
 
 		 616 aa  76.3  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  22.96 
 
 		 618 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  26.8 
 
 		 626 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  26.69 
 
 		 822 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  24.3 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  22.59 
 
 		 758 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  23.99 
 
 		 820 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 822 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  22.91 
 
 		 570 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 826 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  24.9 
 
 		 891 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  27.13 
 
 		 823 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  24.23 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  22.67 
 
 		 656 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  22.37 
 
 		 833 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  22.66 
 
 		 661 aa  55.1  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  22.77 
 
 		 577 aa  53.9  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  24.62 
 
 		 671 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  20.69 
 
 		 826 aa  53.5  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  23.62 
 
 		 824 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  27.17 
 
 		 560 aa  51.2  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  21.46 
 
 		 578 aa  50.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  20.17 
 
 		 648 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  21.45 
 
 		 825 aa  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  26.15 
 
 		 509 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 839 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  24.06 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  22.12 
 
 		 623 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 826 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 826 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  23.78 
 
 		 676 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  22.17 
 
 		 841 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  23.77 
 
 		 812 aa  47  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  22.92 
 
 		 617 aa  47  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  23.04 
 
 		 607 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  23.29 
 
 		 632 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  22.32 
 
 		 841 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  28.04 
 
 		 837 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  23.08 
 
 		 673 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  27.97 
 
 		 239 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  23.24 
 
 		 627 aa  43.5  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  32.05 
 
 		 238 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>