161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1321 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  100 
 
 		 396 aa  827    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  53.18 
 
 		 391 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  39.39 
 
 		 401 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  37.94 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  22.22 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  24.78 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  27.57 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  24 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  26.51 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  31.29 
 
 		 336 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  24.32 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  25.21 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  29.41 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  23.43 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  23.86 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  26.42 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  23.1 
 
 		 326 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  21.83 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  25 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.12 
 
 		 273 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  26.92 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3318  hypothetical protein  28.97 
 
 		 243 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  28.38 
 
 		 250 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 219 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  22.48 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  22.75 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.15 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  26.51 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  24.26 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  23.42 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  21.71 
 
 		 1340 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  24.38 
 
 		 279 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  21.47 
 
 		 681 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 208 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 303 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  24.26 
 
 		 333 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.34 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  22.92 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.11 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1544  Generic methyltransferase  29.63 
 
 		 201 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  26.39 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  22.22 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1124 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  32.04 
 
 		 236 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  25.5 
 
 		 214 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  20.31 
 
 		 286 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  24.07 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  22.34 
 
 		 215 aa  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  22.02 
 
 		 513 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  23.92 
 
 		 214 aa  49.7  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  32.93 
 
 		 542 aa  49.7  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.2 
 
 		 277 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 581 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  24.19 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 		 1177 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  22.22 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.33 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 		 1177 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  25.38 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  20.94 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 1314 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  24.11 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  21.12 
 
 		 607 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  21.96 
 
 		 228 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  26 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.15 
 
 		 229 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.73 
 
 		 268 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 310 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 259 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 		 1106 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  25.83 
 
 		 298 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 266 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 278 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3192  methyltransferase type 12  26.82 
 
 		 243 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  27.22 
 
 		 1046 aa  46.6  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  23.03 
 
 		 217 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  23.38 
 
 		 274 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  22.48 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  23.72 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  23.72 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  25.79 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1208  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  26.15 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  34.15 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 266 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>