244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1159 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 122 aa  255  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  84.43 
 
 		 122 aa  222  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  80.33 
 
 		 122 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  80.33 
 
 		 122 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  80.33 
 
 		 122 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  79.51 
 
 		 122 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  82.79 
 
 		 122 aa  210  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  79.51 
 
 		 122 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  79.51 
 
 		 122 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  79.51 
 
 		 122 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  79.51 
 
 		 122 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  78.69 
 
 		 122 aa  206  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  71.31 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  63.93 
 
 		 122 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  58.62 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  57.76 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  56.9 
 
 		 135 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  56.9 
 
 		 134 aa  151  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  55.17 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  56.03 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  54.31 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  52.14 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  52.14 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  50.88 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  49.17 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 314 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 341 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  30.43 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  30.43 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 319 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1269  conserved hypothetical protein, putative acyl-coA thioester hydrolase  36.79 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00039467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  31.25 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.53 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.83 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3496  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  31.53 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1875  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1278  acyl-CoA hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76332  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.36 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 270 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3058  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 		 327 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 130 aa  48.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  32.41 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  32.41 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  32.41 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  32.41 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  32.41 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  32.41 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>