224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1158 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  80.52 
 
 		 498 aa  841    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  80.44 
 
 		 501 aa  845    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  81.05 
 
 		 496 aa  853    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  81.12 
 
 		 498 aa  825    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  81.33 
 
 		 498 aa  826    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  81.85 
 
 		 496 aa  865    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  81.12 
 
 		 498 aa  825    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  80.24 
 
 		 499 aa  833    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  80.52 
 
 		 498 aa  841    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  80.52 
 
 		 498 aa  841    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  100 
 
 		 502 aa  1039    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  59.1 
 
 		 543 aa  555  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  55.6 
 
 		 527 aa  551  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  57.73 
 
 		 543 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  57.29 
 
 		 546 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  57.08 
 
 		 546 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  57.29 
 
 		 545 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  56.26 
 
 		 545 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  56.88 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  56.26 
 
 		 545 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  56.26 
 
 		 545 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  56.26 
 
 		 545 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  51.59 
 
 		 532 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  57.91 
 
 		 535 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  52.78 
 
 		 616 aa  507  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  52.95 
 
 		 527 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  51.59 
 
 		 552 aa  501  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  55.44 
 
 		 527 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  52.7 
 
 		 640 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  50.78 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  47.92 
 
 		 565 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  49.51 
 
 		 548 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  47.8 
 
 		 568 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  47.69 
 
 		 565 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  44.78 
 
 		 576 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  46.48 
 
 		 568 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  44.9 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  42.3 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  42.95 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  41.87 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  40.81 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  75.52 
 
 		 215 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  38.45 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  40.77 
 
 		 478 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  38.76 
 
 		 471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  38.59 
 
 		 470 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  38.81 
 
 		 468 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  37.53 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  36.97 
 
 		 485 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  38.88 
 
 		 467 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  38.88 
 
 		 467 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  38.88 
 
 		 467 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  38.88 
 
 		 467 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  38.53 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  38.88 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  38.88 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  38.27 
 
 		 557 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  38.16 
 
 		 486 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  38.66 
 
 		 467 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  37.77 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  37.55 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  39.48 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  37.55 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  37.55 
 
 		 476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  37.55 
 
 		 476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  39.45 
 
 		 577 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  37.16 
 
 		 483 aa  243  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  36.81 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  37.34 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  30.6 
 
 		 589 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  30.1 
 
 		 584 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  29.71 
 
 		 585 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  29.19 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  32.12 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  29.45 
 
 		 581 aa  150  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  31.99 
 
 		 671 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  28.97 
 
 		 581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  34.76 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  29.04 
 
 		 581 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  31.82 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  28.51 
 
 		 584 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  29.38 
 
 		 585 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  29.38 
 
 		 585 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  28.02 
 
 		 609 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  27.94 
 
 		 580 aa  143  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  33.53 
 
 		 589 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  30.61 
 
 		 635 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  28.31 
 
 		 584 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  28.16 
 
 		 584 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  33.63 
 
 		 676 aa  137  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  29.28 
 
 		 475 aa  137  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  26.55 
 
 		 547 aa  136  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  29.55 
 
 		 575 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  32.48 
 
 		 525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  29.44 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  32.3 
 
 		 559 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  30.23 
 
 		 476 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  31.25 
 
 		 525 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  29.71 
 
 		 541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  30.59 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>