More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1123 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 368 aa  770    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  70.47 
 
 		 372 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  69.92 
 
 		 372 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  71.02 
 
 		 365 aa  529  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  69.64 
 
 		 372 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  67.83 
 
 		 382 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  69.52 
 
 		 354 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  70.49 
 
 		 368 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  71.02 
 
 		 363 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  71.51 
 
 		 370 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  71.23 
 
 		 362 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  71.02 
 
 		 363 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  71.02 
 
 		 363 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  70.74 
 
 		 363 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  67.34 
 
 		 357 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  68.38 
 
 		 357 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  61.74 
 
 		 352 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  60.58 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  60.58 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  60.58 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  60.29 
 
 		 350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  60.29 
 
 		 360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  60.58 
 
 		 360 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  60.58 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  60.58 
 
 		 360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  60.58 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  58.59 
 
 		 381 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  58.26 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  58.26 
 
 		 350 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  58.26 
 
 		 350 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  57.97 
 
 		 350 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  57.97 
 
 		 350 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  59.42 
 
 		 371 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  58.97 
 
 		 419 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  58.84 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  58 
 
 		 368 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  59.71 
 
 		 354 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  57.14 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  57.86 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  59.35 
 
 		 363 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  58.36 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  55.17 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  56.9 
 
 		 350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0376  A/G-specific adenine glycosylase  56.21 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.798144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  55.39 
 
 		 353 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.68 
 
 		 370 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.19 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  50.14 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  49.86 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  50.73 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.89 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.87 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  50.73 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  54 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  50.44 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  50.15 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.14 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  54.25 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  49.85 
 
 		 355 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  51.02 
 
 		 355 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  50.15 
 
 		 355 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.6 
 
 		 355 aa  355  7.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  49.57 
 
 		 350 aa  349  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  48.02 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  48.55 
 
 		 353 aa  345  7e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  49.57 
 
 		 354 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  49.57 
 
 		 354 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  53.14 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.83 
 
 		 375 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  48.31 
 
 		 350 aa  332  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  43.35 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  45.09 
 
 		 368 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.16 
 
 		 361 aa  328  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  45.09 
 
 		 368 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  45.09 
 
 		 368 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.8 
 
 		 368 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.08 
 
 		 368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  44.96 
 
 		 368 aa  326  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  43.97 
 
 		 370 aa  325  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  47.54 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  47.25 
 
 		 355 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  45.7 
 
 		 351 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  48.53 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  48.53 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  48.53 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  44.54 
 
 		 353 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  48.21 
 
 		 368 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  48.21 
 
 		 368 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  48.21 
 
 		 368 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  48.21 
 
 		 368 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.8 
 
 		 344 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.32 
 
 		 345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  45.98 
 
 		 368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  45.69 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  44.19 
 
 		 374 aa  302  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  43.52 
 
 		 359 aa  298  7e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  43.97 
 
 		 383 aa  295  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  42.32 
 
 		 349 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  44.41 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1141  A/G-specific adenine glycosylase  42.49 
 
 		 358 aa  282  5.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>