218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1094 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  69.05 
 
 		 481 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  73.03 
 
 		 468 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  73.29 
 
 		 468 aa  692    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  73.48 
 
 		 468 aa  653    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  73.08 
 
 		 468 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  69.68 
 
 		 481 aa  670    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  73.29 
 
 		 468 aa  688    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  69.1 
 
 		 467 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  72 
 
 		 468 aa  651    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  73.48 
 
 		 468 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  100 
 
 		 468 aa  953    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  74.95 
 
 		 477 aa  716    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  71.64 
 
 		 469 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  72.96 
 
 		 466 aa  684    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  74.64 
 
 		 414 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  56.67 
 
 		 472 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  46.25 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  47.37 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  49.19 
 
 		 473 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  45.01 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  46.1 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  42.86 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  40.04 
 
 		 468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  39.77 
 
 		 525 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  38.53 
 
 		 495 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  37.36 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  34.08 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  35.04 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  34.64 
 
 		 463 aa  236  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  35.76 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  34.87 
 
 		 580 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  27.66 
 
 		 525 aa  144  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  27.87 
 
 		 539 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  24.95 
 
 		 552 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  26.84 
 
 		 544 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  25.18 
 
 		 578 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  25.35 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.84 
 
 		 487 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  25.86 
 
 		 456 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  27.5 
 
 		 497 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  25.78 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.64 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  27.8 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  23.01 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  26.53 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  28.05 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  23.27 
 
 		 698 aa  71.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  30.51 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  25.06 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  40.22 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  32.12 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  27.95 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  35.77 
 
 		 559 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  28.57 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  23.36 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  29.46 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  32.89 
 
 		 550 aa  63.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  40.51 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  28.24 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  36 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  30.17 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  22.82 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  28.37 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  40.22 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  30.88 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  27.69 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  32.63 
 
 		 734 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  28.83 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  27.78 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  33.09 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  32.26 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  30.14 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.27 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  35.64 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  30.46 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  32.12 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  26.61 
 
 		 291 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  23.04 
 
 		 466 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  36.21 
 
 		 514 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  36.94 
 
 		 536 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  38.46 
 
 		 518 aa  57  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  22.45 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  24.41 
 
 		 506 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  36.94 
 
 		 535 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  38.1 
 
 		 518 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  21.33 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  21.99 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  33.05 
 
 		 512 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  22.81 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  43.48 
 
 		 512 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  21.99 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  36 
 
 		 575 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  34.11 
 
 		 529 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  25.89 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  27.43 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  22.27 
 
 		 459 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  21.99 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  26.63 
 
 		 775 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  43.43 
 
 		 629 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  21.11 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>