233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1042 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  88.49 
 
 
391 aa  652  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  81.54 
 
 
391 aa  634  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  88.34 
 
 
399 aa  657  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 
391 aa  764  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  82.22 
 
 
389 aa  634  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  80.67 
 
 
389 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  80.93 
 
 
389 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  80.67 
 
 
391 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  80.93 
 
 
389 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  80.93 
 
 
389 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  82.73 
 
 
389 aa  626  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  82.22 
 
 
389 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  82.22 
 
 
389 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  77.95 
 
 
394 aa  615  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2778  pH-dependent sodium/proton antiporter  70.84 
 
 
398 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.63 
 
 
382 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.35639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.36 
 
 
398 aa  439  1e-122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  57.54 
 
 
396 aa  438  1e-122  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.08 
 
 
391 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  60.77 
 
 
383 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.53 
 
 
388 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.05 
 
 
382 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.53 
 
 
388 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.53 
 
 
388 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.53 
 
 
388 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.53 
 
 
388 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.48 
 
 
394 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.29218e-06  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.61 
 
 
394 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.17181e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.61 
 
 
394 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  62.11 
 
 
388 aa  421  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.11 
 
 
388 aa  421  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.11 
 
 
388 aa  421  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.84 
 
 
388 aa  421  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.84 
 
 
388 aa  421  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.11 
 
 
388 aa  421  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.84 
 
 
388 aa  421  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.11 
 
 
388 aa  421  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.47 
 
 
391 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  61.84 
 
 
388 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.41 
 
 
390 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.22 
 
 
397 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.22 
 
 
397 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.05 
 
 
391 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.11 
 
 
391 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.5 
 
 
395 aa  405  1e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  1.93238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.55 
 
 
392 aa  400  1e-110  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  52.94 
 
 
391 aa  401  1e-110  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.47 
 
 
395 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.04 
 
 
398 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.77 
 
 
409 aa  385  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.04 
 
 
398 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  53.12 
 
 
382 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.9 
 
 
397 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  51.4 
 
 
401 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.51 
 
 
401 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  49.23 
 
 
386 aa  369  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  53.42 
 
 
392 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  51.17 
 
 
424 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.95 
 
 
392 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.56 
 
 
397 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  49.23 
 
 
394 aa  362  6e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.43 
 
 
399 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  51.28 
 
 
391 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  50.78 
 
 
425 aa  357  1e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.73 
 
 
399 aa  357  2e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.78 
 
 
396 aa  357  2e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  53.26 
 
 
399 aa  356  3e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  51.59 
 
 
393 aa  356  4e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  48.95 
 
 
382 aa  356  4e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.68 
 
 
400 aa  355  8e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.42 
 
 
400 aa  354  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.59 
 
 
400 aa  354  2e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  48.03 
 
 
382 aa  353  3e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  48.03 
 
 
382 aa  352  9e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  45.69 
 
 
396 aa  350  3e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  48.84 
 
 
408 aa  345  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  43.94 
 
 
455 aa  345  9e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.45 
 
 
400 aa  338  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.88 
 
 
399 aa  338  1e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.94 
 
 
407 aa  338  1e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.15 
 
 
391 aa  336  3e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.77 
 
 
389 aa  336  5e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.24 
 
 
389 aa  335  6e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.24 
 
 
389 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  52.41 
 
 
391 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  47.2 
 
 
406 aa  327  2e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0343  Na+/H+ antiporter NhaA  48.43 
 
 
390 aa  325  6e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00697449  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1489  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.63 
 
 
384 aa  324  2e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  50.91 
 
 
413 aa  322  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  50.91 
 
 
413 aa  321  1e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  44.04 
 
 
451 aa  321  1e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  44.04 
 
 
436 aa  321  1e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  43.57 
 
 
444 aa  320  2e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  47.4 
 
 
389 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  48.36 
 
 
424 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2336  Na+/H+ antiporter NhaA  46.46 
 
 
403 aa  315  6e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000768129  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4502  Na+/H+ antiporter NhaA  52.79 
 
 
400 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.97 
 
 
393 aa  314  2e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  43.81 
 
 
408 aa  313  4e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  49.2 
 
 
398 aa  313  4e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>