43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1007 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1007  major outer membrane lipoprotein, putative  100 
 
 		 88 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000269001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2985  major outer membrane lipoprotein, putative  89.77 
 
 		 88 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73465  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3159  major outer membrane lipoprotein, putative  87.5 
 
 		 88 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.764364  normal  0.139344 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1231  major outer membrane lipoprotein, putative  87.5 
 
 		 88 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.942856  normal  0.491239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1154  major outer membrane lipoprotein, putative  87.5 
 
 		 88 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0547044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1198  major outer membrane lipoprotein, putative  87.5 
 
 		 88 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0970  major outer membrane lipoprotein, putative  89.77 
 
 		 88 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000394431  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2824  major outer membrane lipoprotein, putative  92.05 
 
 		 88 aa  133  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000186041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1083  major outer membrane lipoprotein, putative  95.45 
 
 		 88 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000293694  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1165  major outer membrane lipoprotein, putative  93.18 
 
 		 88 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000170818  hitchhiker  0.000784933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1295  major outer membrane lipoprotein, putative  90.91 
 
 		 88 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2898  major outer membrane lipoprotein, putative  89.77 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156021  hitchhiker  0.000454022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2980  major outer membrane lipoprotein, putative  89.77 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000253296  normal  0.0290676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3077  major outer membrane lipoprotein, putative  89.77 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000256665  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1114  major outer membrane lipoprotein, putative  87.5 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0833  major outer membrane lipoprotein, putative  88.37 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000224334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2623  major outer membrane lipoprotein, putative  47.73 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0202513  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4194  putative major outer membrane lipoprotein  50.62 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.719442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2583  major outer membrane lipoprotein  33.71 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000315895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1748  major outer membrane lipoprotein  33.71 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.4636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1854  LPP repeat-containing protein  33.71 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000796453  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1474  major outer membrane lipoprotein  32.58 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000804906  normal  0.0109348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1701  LPP repeat-containing protein  38.04 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000609145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1510  major outer membrane lipoprotein  32.58 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000917327  hitchhiker  0.00000000217872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1794  major outer membrane lipoprotein  32.58 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000710111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1490  major outer membrane lipoprotein  32.58 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000317688  hitchhiker  0.0000000000000124306 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1663  LPP repeat-containing protein  38.04 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000205201  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1965  major outer membrane lipoprotein  32.58 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000537115  decreased coverage  0.000000000167771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2442  LPP repeat-containing protein  32.58 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000387277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2186  LPP repeat-containing protein  32.58 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000306733  hitchhiker  0.000000305308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2745  LPP repeat-containing protein  32.58 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000753676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1767  LPP repeat-containing protein  31.46 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000800001  unclonable  0.00000127827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2391  major outer membrane lipoprotein  31.76 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000996739  decreased coverage  0.0000025912 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01636  hypothetical protein  31.76 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1965  LPP repeat-containing protein  31.76 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  8.12979e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1878  major outer membrane lipoprotein  31.76 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1519  major outer membrane lipoprotein  31.76 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000133689  decreased coverage  0.000000000978616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1954  LPP repeat-containing protein  31.76 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000368464  unclonable  0.00000000844814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1893  major outer membrane lipoprotein  31.76 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000101718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1758  major outer membrane lipoprotein  31.76 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.20557e-22  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01646  murein lipoprotein  31.76 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000290635  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001254  outer membrane lipoprotein  47.73 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05124  hypothetical protein  45.45 
 
 		 82 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>