209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0983 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  100 
 
 		 445 aa  917    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  56.97 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  52.93 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  53.59 
 
 		 461 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  48.88 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  52.77 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  48.43 
 
 		 486 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  47.99 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  44.6 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  46.12 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  44.58 
 
 		 482 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  44.16 
 
 		 436 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  44.63 
 
 		 426 aa  342  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  43.34 
 
 		 447 aa  341  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  39.3 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  43.22 
 
 		 456 aa  315  7e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  43.46 
 
 		 419 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  42.19 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  39.17 
 
 		 440 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  37.9 
 
 		 451 aa  270  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  39.08 
 
 		 459 aa  266  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  37.44 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  37.44 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  34.27 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  34.12 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  34.12 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  36.62 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  34.2 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  34.03 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  34.8 
 
 		 419 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  33.02 
 
 		 416 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  33.49 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  34.57 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  34.27 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  36.83 
 
 		 417 aa  216  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  34.12 
 
 		 411 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  32.94 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  33.57 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  33.88 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  33.33 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  33.26 
 
 		 407 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  33.73 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  30.42 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  33.33 
 
 		 409 aa  203  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  32.43 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  34.37 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  32.14 
 
 		 411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  32.94 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  34.41 
 
 		 405 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  31 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  30.9 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  33.26 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  30.59 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  32.5 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  31.42 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  32.99 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  33.82 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  31.02 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.35 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  33.02 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  32.57 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  30.07 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.8 
 
 		 430 aa  163  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  31.13 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  31.07 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.24 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  27.85 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.24 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  31 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  31.94 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  32.45 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  31.95 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  32.69 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  31.05 
 
 		 403 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.88 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.88 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.88 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.21 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.48 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  32.77 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  31.21 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  30.34 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.05 
 
 		 413 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  29.81 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  29.81 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  29.81 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  29.2 
 
 		 407 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  31.75 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  31.12 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  30.33 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  31.22 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  29.77 
 
 		 400 aa  136  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  29.79 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  30.41 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  28.07 
 
 		 428 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.09 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  30.86 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  30.77 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  30.79 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.09 
 
 		 455 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>