98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0898 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 311 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  57.77 
 
 		 294 aa  362  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  55.67 
 
 		 292 aa  362  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  55.11 
 
 		 304 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  50.16 
 
 		 304 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  55.17 
 
 		 291 aa  342  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  53.79 
 
 		 287 aa  341  8e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  53.45 
 
 		 287 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  54.83 
 
 		 287 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  52.61 
 
 		 304 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  54.48 
 
 		 287 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  54.24 
 
 		 288 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  55.93 
 
 		 268 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  53.18 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 327 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  29.72 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  30.71 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  26.45 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  28.38 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  28.62 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0806  MltA-interacting MipA family protein  29.53 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  27.56 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  27.06 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  28.24 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  27.66 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  28.24 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  28.24 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  27.06 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  27.66 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  27.66 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  27.66 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  27.66 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  27.66 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  27.66 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  27.66 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  27.66 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  24.33 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  30.25 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  29.8 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  32.03 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  32 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  23.71 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  23.71 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  23.71 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  24.35 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  28.4 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  29.94 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  28.4 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  28.4 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  27.65 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  28.82 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  22.7 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  22.93 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  21.18 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  26.63 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  27.78 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  27.22 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  21.57 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  27.78 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  27.78 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  27.78 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  21.18 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  21.18 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  21.18 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  21.18 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  21.18 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  21.18 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  21.75 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  24.1 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  30.69 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  26.32 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  24.34 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  25 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  22.6 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  24.5 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  19.01 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3064  MltA-interacting MipA family protein  27.2 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  22.37 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  23.21 
 
 		 257 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  22.3 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  26.17 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  22.73 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  24.69 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  20.86 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  26.05 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  24.5 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3692  MltA-interacting MipA family protein  23.2 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252512  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  23.13 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  22.64 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3503  MltA-interacting MipA family protein  23.2 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  24.49 
 
 		 270 aa  43.1  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3980  MltA-interacting MipA family protein  22.58 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3571  MltA-interacting MipA family protein  23.2 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0747  MltA-interacting MipA family protein  23.2 
 
 		 281 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  22.52 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>