239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0877 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0877  diadenosine tetraphosphatase  100 
 
 
274 aa  568  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0962  diadenosine tetraphosphatase  63.87 
 
 
274 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1012  diadenosine tetraphosphatase  62.41 
 
 
274 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.493467  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1044  diadenosine tetraphosphatase  62.04 
 
 
274 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1077  diadenosine tetraphosphatase  61.68 
 
 
274 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3117  diadenosine tetraphosphatase  62.27 
 
 
274 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0987  diadenosine tetraphosphatase  62.04 
 
 
274 aa  361  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.341125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0975  diadenosine tetraphosphatase  61.68 
 
 
274 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3315  diadenosine tetraphosphatase  61.31 
 
 
274 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3211  diadenosine tetraphosphatase  61.17 
 
 
274 aa  358  7e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.878337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0860  diadenosine tetraphosphatase  60.66 
 
 
277 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3641  diadenosine tetraphosphatase  60.95 
 
 
274 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0903  diadenosine tetraphosphatase  61.54 
 
 
274 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3081  diadenosine tetraphosphatase  59.41 
 
 
272 aa  353  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2890  diadenosine tetraphosphatase  57.72 
 
 
273 aa  322  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.312502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2821  diadenosine tetraphosphatase  54.41 
 
 
270 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0367  diadenosine tetraphosphatase  47.64 
 
 
273 aa  272  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  49.82 
 
 
268 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1558  diadenosine tetraphosphatase  47.43 
 
 
273 aa  261  8e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001667  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  48.71 
 
 
268 aa  260  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0722  diadenosine tetraphosphatase  47.39 
 
 
283 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3834  diadenosine tetraphosphatase  46.35 
 
 
281 aa  259  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00053  diadenosinetetraphosphatase  48.51 
 
 
280 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3550  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  48.51 
 
 
280 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0053  diadenosine tetraphosphatase  48.51 
 
 
280 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0296879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0054  diadenosine tetraphosphatase  48.51 
 
 
282 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257316  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0055  diadenosine tetraphosphatase  48.51 
 
 
280 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00052  hypothetical protein  48.51 
 
 
280 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3606  diadenosine tetraphosphatase  48.51 
 
 
280 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0053  diadenosine tetraphosphatase  48.51 
 
 
282 aa  259  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.627509  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0043  diadenosine tetraphosphatase  48.51 
 
 
280 aa  259  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0600  diadenosine tetraphosphatase  47.6 
 
 
280 aa  258  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3575  diadenosine tetraphosphatase  47.06 
 
 
289 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0561  diadenosine tetraphosphatase  47.97 
 
 
281 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3446  diadenosine tetraphosphatase  47.06 
 
 
289 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0099  diadenosine tetraphosphatase  47.39 
 
 
282 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0774  diadenosine tetraphosphatase  46.69 
 
 
289 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0469096  normal  0.0479876 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0097  diadenosine tetraphosphatase  47.39 
 
 
282 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0093  diadenosine tetraphosphatase  47.39 
 
 
282 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.413361 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0094  diadenosine tetraphosphatase  47.39 
 
 
282 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0092  diadenosine tetraphosphatase  47.39 
 
 
282 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.533237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3637  diadenosine tetraphosphatase  45.9 
 
 
281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  46.27 
 
 
282 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1046  diadenosine tetraphosphatase  46.3 
 
 
276 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.78168  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  44.85 
 
 
293 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2859  diadenosine tetraphosphatase  46.35 
 
 
269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000394159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  44.85 
 
 
283 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4527  diadenosine tetraphosphatase  44.53 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  46.59 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4015  diadenosine tetraphosphatase  45.04 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  43.75 
 
 
283 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46850  diadenosine tetraphosphatase  44.32 
 
 
277 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0562  diadenosine tetraphosphatase  43.66 
 
 
288 aa  236  3e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4803  diadenosine tetraphosphatase  43.98 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  43.94 
 
 
288 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  43.94 
 
 
288 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1983  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  45.45 
 
 
275 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26306  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2156  diadenosine tetraphosphatase  45 
 
 
281 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.699429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1149  diadenosine tetraphosphatase  45.74 
 
 
280 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0549  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase, symmetrical  42.64 
 
 
300 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03416  diadenosine tetraphosphatase  43.77 
 
 
275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0436512  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  42.22 
 
 
275 aa  221  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4629  diadenosine tetraphosphatase  43.02 
 
 
291 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3506  diadenosine tetraphosphatase  44.74 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.767842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  44.11 
 
 
278 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  43.35 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1143  diadenosine tetraphosphatase  44.19 
 
 
281 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281223  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1064  diadenosine tetraphosphatase  44.19 
 
 
281 aa  215  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1345  diadenosine tetraphosphatase  41.29 
 
 
278 aa  215  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.399511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0735  diadenosine tetraphosphatase  43.56 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1658  diadenosine tetraphosphatase  38.89 
 
 
282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0467  diadenosine tetraphosphatase  42.75 
 
 
277 aa  212  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0215595  normal  0.520135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2728  diadenosine tetraphosphatase  41.83 
 
 
270 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3423  diadenosine tetraphosphatase  43.8 
 
 
266 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.79123  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  41.83 
 
 
265 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0922  diadenosine tetraphosphatase  42.16 
 
 
272 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0753757  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2854  diadenosine tetraphosphatase  42.75 
 
 
273 aa  205  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  43.56 
 
 
273 aa  205  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0908  diadenosine tetraphosphatase  39.56 
 
 
278 aa  202  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140647  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2384  diadenosine tetraphosphatase  42.37 
 
 
273 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3200  diadenosine tetraphosphatase  42.15 
 
 
285 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.238496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  43.02 
 
 
276 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0743  diadenosine tetraphosphatase  41.35 
 
 
279 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0223  diadenosine tetraphosphatase  38.43 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0760  diadenosine tetraphosphatase  40.6 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0962  diadenosine tetraphosphatase  37.41 
 
 
280 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3856  diadenosine tetraphosphatase  37.99 
 
 
283 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3968  diadenosine tetraphosphatase  40.6 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.383712  normal  0.638877 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0206  diadenosine tetraphosphatase  40.73 
 
 
275 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1455  diadenosine tetraphosphatase  37.78 
 
 
280 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1340  diadenosine tetraphosphatase  40.61 
 
 
275 aa  191  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00498916  hitchhiker  0.000879118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3805  diadenosine tetraphosphatase  41.22 
 
 
292 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04647  diadenosine tetraphosphatase  39.93 
 
 
318 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.242571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2518  diadenosine tetraphosphatase  40.22 
 
 
278 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.284049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0573  diadenosine tetraphosphatase  42.75 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1197  diadenosine tetraphosphatase  40.15 
 
 
278 aa  189  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0643097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0876  diadenosine tetraphosphatase  39.71 
 
 
292 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3027  diadenosine tetraphosphatase  36.3 
 
 
282 aa  188  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0097  diadenosine tetraphosphatase  39.03 
 
 
291 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0625  diadenosine tetraphosphatase  41.63 
 
 
282 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>