69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0817 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0817  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 105 aa  219  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1476  cupin family protein  72.38 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000241751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0948  cupin 2 domain-containing protein  72.38 
 
 		 105 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0846  cupin 2 domain-containing protein  64.76 
 
 		 105 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0763  cupin family protein  62.86 
 
 		 105 aa  146  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0804  cupin 2 domain-containing protein  60.4 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0832  cupin 2 domain-containing protein  60.4 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1847  hypothetical protein  52.38 
 
 		 105 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3135  cupin 2 domain-containing protein  58.42 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3511  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.41 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5251  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.45 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3793  hypothetical protein  59.41 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3702  cupin 2 domain-containing protein  58.42 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06907  hypothetical protein  54.46 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0837  cupin 2 domain-containing protein  57.43 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.665857  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2292  hypothetical protein  52.48 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3989  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.92 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0189718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0578  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  53.92 
 
 		 109 aa  114  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000905  lipid A 3-O-deacylase  50.5 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.5 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1869  hypothetical protein  51.96 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2347  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  51.96 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2341  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  55 
 
 		 110 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.443612  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60 
 
 		 116 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.525951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.54 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.249211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1446  hypothetical protein  48.51 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.48833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1497  hypothetical protein  57.78 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389737  normal  0.287846 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1589  hypothetical protein  48.51 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0676  hypothetical protein  47.52 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2854  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  47.52 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1558  hypothetical protein  52.94 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1304  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.5 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0389028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4261  cupin 2 domain-containing protein  51.49 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4122  hypothetical protein  45.71 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1004  hypothetical protein  43.27 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.193395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3968  cupin 2, barrel  45.71 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4627  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.49 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45610  hypothetical protein  47.52 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6099  cupin 2 domain-containing protein  53.33 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2487  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.12 
 
 		 122 aa  91.3  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2477  cupin 2 domain-containing protein  45.37 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.890944  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1495  cupin 2 domain-containing protein  41.51 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6036  cupin 2 domain-containing protein  47.78 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6918  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.08 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3568  hypothetical protein  43.52 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3547  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.59 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2206  cupin 2 domain-containing protein  43.52 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2566  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.59 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5672  cupin 2, barrel  47.78 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6526  cupin 2 domain-containing protein  47.78 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2353  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4044  cupin 2 domain-containing protein  40.57 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4502  cupin 2 domain-containing protein  39.62 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.17 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2846  hypothetical protein  45.1 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341325  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1914  cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7450  hypothetical protein  40.57 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1490  hypothetical protein  43.14 
 
 		 113 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1597  cupin 2, barrel-containing protein  40.78 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00444258  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0980  cupin 2, barrel  43.14 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6465  cupin 2 domain-containing protein  45.54 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0067  cupin 2 domain-containing protein  42.16 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0540869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0995  hypothetical protein  43.24 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.918435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0900  hypothetical protein  41.18 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0739  cupin 2 domain-containing protein  58.82 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2130  cupin 2, barrel  31.82 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0011  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.01 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0738  hypothetical protein  55.56 
 
 		 42 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>