95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0671 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0671  phospholipase A(1)  100 
 
 
308 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0786  phospholipase A(2)  77.24 
 
 
331 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000253748  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2893  phospholipase A(1)  79.27 
 
 
294 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406864  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0681  phospholipase A(1)  79.64 
 
 
297 aa  461  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00937714  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0661  phospholipase A(1)  76.53 
 
 
321 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0955  phospholipase A1  70.96 
 
 
305 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000243291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3189  phospholipase A(1)  77.29 
 
 
302 aa  447  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0861  phospholipase A1  70.63 
 
 
294 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000319394  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3074  phospholipase A(1)  69.84 
 
 
294 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144403  normal  0.81386 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0898  phospholipase A(1)  69.31 
 
 
294 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110394  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3045  phospholipase A(1)  69.64 
 
 
293 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0926  phospholipase A(1)  73.26 
 
 
294 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0960  phospholipase A(1)  72.89 
 
 
294 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213217  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3410  phospholipase A(1)  73.26 
 
 
294 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0952  Phospholipase A(1)  73.26 
 
 
294 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23865  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3432  Phospholipase A(1)  46.26 
 
 
302 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000246  outer membrane phospholipase A  45.45 
 
 
342 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3291  phospholipase A(1)  47.31 
 
 
331 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20613  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0489  phospholipase A1  45 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0096  phospholipase  43.75 
 
 
352 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0828092  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1446  phospholipase A1  42.21 
 
 
335 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02967  Outer membrane phospholipase A  45.09 
 
 
339 aa  228  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1960  phospholipase A1  46.04 
 
 
345 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2081  phospholipase A1  44.08 
 
 
296 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0459  phospholipase A(1)  42.91 
 
 
365 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0625  phospholipase A(1)  43.17 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3493  phospholipase A(1)  39.93 
 
 
285 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1437  Phospholipase A(2)  41.76 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.373887  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0217  phospholipase A  37.67 
 
 
292 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3999  phospholipase A  37.67 
 
 
292 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000768717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2651  Phospholipase A(1)  38.95 
 
 
384 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0554  phospholipase A  37.67 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0241  phospholipase A  35.69 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0192  phospholipase A  35.47 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0192  phospholipase A  40.38 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2263  Phospholipase A(2)  37.89 
 
 
334 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000355963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4155  phospholipase A  35.69 
 
 
288 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00523334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2175  Phospholipase A(2)  35.71 
 
 
310 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1540  phospholipase A  40.4 
 
 
329 aa  175  7e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1350  phospholipase A  41.13 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0197  phospholipase A  38.49 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2191  putative two-component sensor  38.46 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00189508  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0231  outer membrane phospholipase A  37.88 
 
 
478 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2026  phospholipase A(1)  37.59 
 
 
433 aa  172  9e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314186  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03700  outer membrane phospholipase A  35.02 
 
 
289 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4188  phospholipase A  35.02 
 
 
289 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0102786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03649  hypothetical protein  35.02 
 
 
289 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4187  phospholipase A  34.68 
 
 
289 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315576  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5262  phospholipase A  34.68 
 
 
289 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.658855 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4158  Phospholipase A(1)  34.68 
 
 
289 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4342  phospholipase A  34.68 
 
 
289 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4045  phospholipase A  34.68 
 
 
289 aa  169  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3965  phospholipase A  38.31 
 
 
290 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1587  phospholipase A1  38.63 
 
 
344 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.168451  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0598  phospholipase A1  38.63 
 
 
344 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000777366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4288  phospholipase A  34.68 
 
 
289 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3975  phospholipase A  33.99 
 
 
289 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00682989  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4344  phospholipase A  35.21 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4186  phospholipase A  35.21 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4165  phospholipase A  35.21 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4284  phospholipase A  35.21 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.271808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4237  phospholipase A  35.21 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0610  phospholipase A  40.23 
 
 
337 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0126  phospholipase A  37.69 
 
 
322 aa  164  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0260  phospholipase A1  34.43 
 
 
472 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.576984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2090  phospholipase A1  32.98 
 
 
343 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152722  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0719  Phospholipase A(2)  41 
 
 
392 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3505  putative phospholipase A1 precursor (PldA)  32.03 
 
 
360 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0598  phospholipase A1  35 
 
 
421 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0016  phospholipase A1  31.56 
 
 
359 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3140  phospholipase A1  35.07 
 
 
393 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2290  phospholipase A1  32.65 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3867  phospholipase A1  36.26 
 
 
405 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  0.459094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4476  phospholipase A1  33.21 
 
 
410 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4284  phospholipase A1  35.19 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0602496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0350  phospholipase A1  34.48 
 
 
401 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53179  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0552  phospholipase A1  32.48 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1995  phospholipase A1 precursor  32.17 
 
 
257 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02036  Outer membrane phospholipase A  33.47 
 
 
239 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0525  phospholipase  29.74 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02841  phospholipase A  32.58 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4607  Outer membrane phospholipase A-like protein  28.43 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0328942  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1069  putative phospholipase  31.6 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2311  putative outer membrane phospholipase A  30.43 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2897  outer membrane phospholipase A  33.19 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1948  putative outer membrane phospholipase A  30.43 
 
 
452 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267427  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1006  putative phospholipase  31.35 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.542974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0928  phospholipase A1  32.89 
 
 
407 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2465  phospholipase A1  31.6 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2871  outer membrane phospholipase A  31.9 
 
 
431 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1042  putative phospholipase  30.87 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1581  hypothetical protein  28.87 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0639269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1397  putative phospholipase  31.74 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.203463  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0769  outer membrane phospholipase A  32.5 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3729  phospholipase A  75 
 
 
49 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>