More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0617 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  85.71 
 
 		 429 aa  713    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  85.48 
 
 		 424 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  90.52 
 
 		 422 aa  759    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  87.38 
 
 		 429 aa  724    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  87.38 
 
 		 429 aa  724    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  100 
 
 		 422 aa  823    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  91.47 
 
 		 422 aa  744    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  89.57 
 
 		 422 aa  742    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  87.38 
 
 		 429 aa  724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  88.39 
 
 		 422 aa  716    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  80.76 
 
 		 422 aa  667    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  87.38 
 
 		 429 aa  721    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  87.14 
 
 		 429 aa  719    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  86.73 
 
 		 422 aa  683    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  87.14 
 
 		 429 aa  720    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  87.38 
 
 		 429 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  87.89 
 
 		 423 aa  717    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  77.32 
 
 		 423 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  73.55 
 
 		 431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  76.01 
 
 		 421 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  67.14 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  66.51 
 
 		 419 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  66.51 
 
 		 419 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  65.88 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  64.81 
 
 		 423 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  64.35 
 
 		 423 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  62.96 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  58.68 
 
 		 417 aa  474  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  59.71 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  58.33 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  58.19 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  59.19 
 
 		 422 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  59.52 
 
 		 418 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  60.74 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  57.07 
 
 		 416 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  58.02 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  47.2 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  47.2 
 
 		 417 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  45.11 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  43.7 
 
 		 397 aa  308  9e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  42.86 
 
 		 402 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  41.04 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  41.87 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  40.78 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  42.92 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  43.4 
 
 		 523 aa  262  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  40.55 
 
 		 429 aa  259  8e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  40.15 
 
 		 411 aa  249  9e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  38.6 
 
 		 461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  41.71 
 
 		 514 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  33.07 
 
 		 514 aa  240  4e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  41.18 
 
 		 524 aa  240  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  37.41 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  37.41 
 
 		 505 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  39.04 
 
 		 520 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  40.37 
 
 		 498 aa  236  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  39.61 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  41.04 
 
 		 549 aa  229  5e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  36.67 
 
 		 494 aa  229  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  39.79 
 
 		 542 aa  226  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  34.33 
 
 		 501 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  36.7 
 
 		 499 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  38.95 
 
 		 502 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  40.33 
 
 		 499 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  41.49 
 
 		 526 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  37.5 
 
 		 500 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  37.74 
 
 		 521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  38.27 
 
 		 494 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  39.52 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  36.13 
 
 		 496 aa  209  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  33.2 
 
 		 521 aa  201  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  48.37 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  35.23 
 
 		 474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  46.33 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  35.25 
 
 		 535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42057  PiT family transporter: phosphate  37.82 
 
 		 538 aa  150  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.870144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119536  high affinity phosphate transporter, probable  38.46 
 
 		 600 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0681687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  28.54 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  35.52 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  36.59 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  36.82 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  44.26 
 
 		 508 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  44.26 
 
 		 508 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  44.97 
 
 		 599 aa  139  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10343  phosphate-repressible Na+/phosphate cotransporter Pho89, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03010)  39.3 
 
 		 580 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0889794  normal  0.570807 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  44.75 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  31.68 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  43.17 
 
 		 508 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  34.9 
 
 		 522 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1038  phosphate transporter  29.77 
 
 		 394 aa  136  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  44.83 
 
 		 516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1021  phosphate transporter  27.02 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.335253 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0998  hypothetical protein  28.88 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.06049  normal  0.558836 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05450  sodium:inorganic phosphate symporter, putative  41.95 
 
 		 596 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  36.07 
 
 		 552 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08956  phosphate-repressible phosphate permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01850)  42.68 
 
 		 571 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11011  conserved hypothetical protein  39.39 
 
 		 558 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.677966 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66490  Na+/Pi symporter  36.89 
 
 		 582 aa  116  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.602489  normal  0.0911162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  37.65 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  26.97 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>