More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0596 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
640 aa  1301    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  63.12 
 
 
641 aa  818    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.66 
 
 
640 aa  957    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  36.35 
 
 
645 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 
645 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 
645 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.37 
 
 
638 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 
636 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 
645 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 
639 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 
643 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.7 
 
 
645 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 
636 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.79 
 
 
638 aa  357  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.79 
 
 
641 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.79 
 
 
638 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.79 
 
 
638 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.983838  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.79 
 
 
638 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.411591  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  34.22 
 
 
642 aa  348  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 
638 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666265  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 
638 aa  347  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 
638 aa  347  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 
638 aa  345  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.408395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.53 
 
 
638 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2239  chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 
648 aa  343  7e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  32.45 
 
 
636 aa  332  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  33.23 
 
 
638 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  32.92 
 
 
638 aa  326  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.49 
 
 
650 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3723  HAMP domain-containing protein  31.27 
 
 
628 aa  292  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.96 
 
 
634 aa  287  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318926  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0552  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.91 
 
 
648 aa  280  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283806  decreased coverage  0.00439756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0604  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 
641 aa  270  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.471742  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 
620 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3736  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 
620 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.0212994 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3785  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 
620 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0060774  normal  0.0147123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  30.41 
 
 
629 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  30.26 
 
 
629 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 
620 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.33 
 
 
620 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.407039  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
648 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4997  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.33 
 
 
620 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.245568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  33.9 
 
 
646 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  32.33 
 
 
639 aa  252  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.19 
 
 
647 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.83 
 
 
648 aa  250  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 
713 aa  250  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.19 
 
 
647 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 
646 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.38 
 
 
626 aa  249  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 
620 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0344374  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  37.98 
 
 
712 aa  247  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  37.73 
 
 
712 aa  247  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  30.51 
 
 
632 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.48 
 
 
647 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  33 
 
 
623 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 
716 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  33.54 
 
 
630 aa  241  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  33.69 
 
 
629 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
630 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  29.57 
 
 
633 aa  239  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
630 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.62 
 
 
630 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
630 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
630 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 
671 aa  239  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  32.03 
 
 
632 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.83 
 
 
629 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 
634 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 
638 aa  236  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 
630 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  39.67 
 
 
545 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 
541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  29.57 
 
 
623 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  41.74 
 
 
545 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  32.91 
 
 
629 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  35.4 
 
 
714 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  32.91 
 
 
628 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  35.08 
 
 
714 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.05 
 
 
632 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.07 
 
 
631 aa  233  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  33.76 
 
 
628 aa  233  8.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.53 
 
 
627 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 
628 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  33.05 
 
 
629 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.05 
 
 
628 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 
620 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 
626 aa  230  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.42 
 
 
630 aa  230  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  35.39 
 
 
578 aa  230  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 
625 aa  230  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.82 
 
 
626 aa  230  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  32.84 
 
 
643 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  34.3 
 
 
626 aa  229  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  30.62 
 
 
627 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 
548 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 
630 aa  229  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  29.65 
 
 
626 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 
558 aa  229  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  29.1 
 
 
626 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>