30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0584 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  230  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  48.21 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  54.64 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  51.11 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  44.95 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  44.66 
 
 		 115 aa  93.6  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  44.66 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  44.66 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  44.66 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414361  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0651  hypothetical protein  44.44 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000188562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3293  hypothetical protein  38.89 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.99 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  31.33 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  31.33 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  31.33 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  31.17 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  31.17 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  31.17 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  31.17 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  28.72 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  31.34 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  26.47 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.93 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.11 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  26.47 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  27.94 
 
 		 104 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>