30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0543 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718066  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  77.78 
 
 		 249 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0773  hypothetical protein  74.8 
 
 		 254 aa  390  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0548647  unclonable  0.0000000000796342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  73.02 
 
 		 245 aa  371  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000019199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  66.4 
 
 		 245 aa  337  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000762567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  66.4 
 
 		 245 aa  337  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  66.01 
 
 		 245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000586351  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0805  hypothetical protein  66.39 
 
 		 231 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000415651  hitchhiker  0.000000000063684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  65.82 
 
 		 231 aa  318  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000795933  hitchhiker  0.0000110881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  64.98 
 
 		 231 aa  315  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000104845  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  64.98 
 
 		 231 aa  315  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000015789  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  63.71 
 
 		 231 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000836076  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  63.56 
 
 		 231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  58.73 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  61.96 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  51.59 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  36.72 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  33.2 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  33.47 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  33.2 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  27.17 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  23.64 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  25.86 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1688  hypothetical protein  26.83 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  27.13 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290926  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  24.52 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  23.48 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  25.43 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1630  hypothetical protein  22.74 
 
 		 273 aa  45.8  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000164262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1874  hypothetical protein  28.76 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>