117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0504 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  100 
 
 		 403 aa  797    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  72.7 
 
 		 403 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  68.73 
 
 		 403 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  65.76 
 
 		 403 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  65.26 
 
 		 403 aa  528  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  64.76 
 
 		 403 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  65.01 
 
 		 403 aa  504  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  43.6 
 
 		 406 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  42.43 
 
 		 414 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  41.46 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  43.07 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  43.07 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  41.94 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  40.82 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  40.35 
 
 		 390 aa  239  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  37.38 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  40.72 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  40.05 
 
 		 390 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  38.59 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  40.34 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  38.42 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  40.1 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  40.1 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  38.05 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  36.8 
 
 		 401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  39.56 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  34.45 
 
 		 409 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  35.78 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  36.81 
 
 		 391 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  33.82 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  34.77 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  34.06 
 
 		 424 aa  169  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  33.67 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  35.8 
 
 		 393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  39.95 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  34.35 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  29.76 
 
 		 406 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  29.76 
 
 		 398 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  29.76 
 
 		 398 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  29.76 
 
 		 398 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  34.64 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  33.49 
 
 		 397 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  32.75 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  29.76 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  32.49 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  31.22 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  29.51 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  30.71 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  30.46 
 
 		 401 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  30.75 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  29.27 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  31.91 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  31.91 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  34.71 
 
 		 393 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  30.72 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  33.84 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  32.24 
 
 		 403 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  32.74 
 
 		 385 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  30.79 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  34.94 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  33.08 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  31.98 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  30.19 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  33.72 
 
 		 384 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  32.67 
 
 		 391 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  31.2 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  29.78 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  31.49 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  33.5 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  30.83 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  29.31 
 
 		 428 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  34.74 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  33.43 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  33.66 
 
 		 393 aa  126  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  33.01 
 
 		 404 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  30.28 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  32.77 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  28.8 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  32.54 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  31.44 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  31.83 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  30.41 
 
 		 407 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  30.05 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  30.83 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  31.03 
 
 		 392 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  28.89 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  29.7 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  29.66 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  29.9 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  29.69 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  29.62 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  29.62 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  29.62 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  30.12 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  32.05 
 
 		 398 aa  107  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  28.75 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  28.04 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0928  NnrS family protein  27.83 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0391816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  30.14 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  30.73 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>