More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0457 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  58.95 
 
 		 969 aa  1223    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  56.8 
 
 		 968 aa  1166    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  56.8 
 
 		 968 aa  1166    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  38.59 
 
 		 982 aa  657    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  48.81 
 
 		 948 aa  899    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  46.78 
 
 		 949 aa  823    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  55.93 
 
 		 967 aa  1149    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  49.02 
 
 		 948 aa  904    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  56.24 
 
 		 967 aa  1152    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  51.99 
 
 		 975 aa  1026    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  83.66 
 
 		 968 aa  1696    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  56.08 
 
 		 968 aa  1150    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  49.07 
 
 		 948 aa  909    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  84.19 
 
 		 968 aa  1704    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  56.8 
 
 		 968 aa  1167    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  42.99 
 
 		 958 aa  803    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  42.89 
 
 		 958 aa  800    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  83.35 
 
 		 968 aa  1697    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  49.38 
 
 		 948 aa  908    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  41.69 
 
 		 982 aa  716    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  56.91 
 
 		 968 aa  1167    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  83.35 
 
 		 968 aa  1697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  58.95 
 
 		 969 aa  1224    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  49.02 
 
 		 948 aa  907    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  83.14 
 
 		 968 aa  1694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  56.8 
 
 		 968 aa  1166    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  49.17 
 
 		 948 aa  904    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  40.23 
 
 		 960 aa  648    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  100 
 
 		 968 aa  1993    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  57.01 
 
 		 968 aa  1173    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  83.35 
 
 		 968 aa  1697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  49.28 
 
 		 949 aa  904    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  58.64 
 
 		 969 aa  1194    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  56.8 
 
 		 968 aa  1166    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  56.8 
 
 		 968 aa  1165    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  58.41 
 
 		 969 aa  1199    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  81.8 
 
 		 968 aa  1655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  56.19 
 
 		 968 aa  1154    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  44.3 
 
 		 980 aa  755    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  41.49 
 
 		 1028 aa  712    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  56.29 
 
 		 968 aa  1155    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  86.05 
 
 		 968 aa  1748    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  48.91 
 
 		 948 aa  904    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  48.03 
 
 		 943 aa  908    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  83.45 
 
 		 968 aa  1697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  56.29 
 
 		 968 aa  1155    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  50.26 
 
 		 966 aa  960    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  83.25 
 
 		 968 aa  1693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  83.45 
 
 		 968 aa  1695    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  81.8 
 
 		 968 aa  1667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  50.57 
 
 		 950 aa  912    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  56.8 
 
 		 968 aa  1165    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  56.03 
 
 		 919 aa  1086    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  46.19 
 
 		 947 aa  853    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  83.35 
 
 		 968 aa  1695    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  56.49 
 
 		 968 aa  1160    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  43.22 
 
 		 953 aa  766    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  48.81 
 
 		 947 aa  894    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  56.19 
 
 		 968 aa  1151    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  56.24 
 
 		 967 aa  1151    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  55.5 
 
 		 944 aa  1108    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  56.19 
 
 		 968 aa  1151    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  56.66 
 
 		 967 aa  1152    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  77.87 
 
 		 967 aa  1551    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  50.46 
 
 		 948 aa  911    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  56.85 
 
 		 970 aa  1160    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  56.29 
 
 		 968 aa  1155    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  83.68 
 
 		 968 aa  1687    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  37.01 
 
 		 942 aa  594  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  35.67 
 
 		 874 aa  544  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  28.22 
 
 		 905 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  27.83 
 
 		 892 aa  211  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  26.98 
 
 		 898 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  27.62 
 
 		 898 aa  204  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  28.04 
 
 		 578 aa  158  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  28.2 
 
 		 560 aa  156  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 		 560 aa  152  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  25.77 
 
 		 560 aa  151  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  26.57 
 
 		 560 aa  150  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  26.57 
 
 		 560 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  26.57 
 
 		 560 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  26.57 
 
 		 560 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  26.57 
 
 		 560 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  27.29 
 
 		 554 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  26.57 
 
 		 560 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  26.57 
 
 		 560 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  26.57 
 
 		 560 aa  150  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.43 
 
 		 555 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1144 aa  147  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  29.1 
 
 		 835 aa  147  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.18 
 
 		 933 aa  140  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  25.45 
 
 		 669 aa  140  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.25 
 
 		 584 aa  136  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.8 
 
 		 1138 aa  134  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  27.51 
 
 		 1046 aa  132  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  28.9 
 
 		 919 aa  128  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  24.82 
 
 		 572 aa  127  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 		 1167 aa  125  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  26.32 
 
 		 945 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  32.87 
 
 		 988 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>