More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0364 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  100 
 
 		 163 aa  338  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  56.07 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  47.65 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  37.35 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  34.86 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  41.67 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  33.16 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  37.14 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  37.93 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  34.22 
 
 		 182 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  39.49 
 
 		 169 aa  97.8  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  35.44 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  32.74 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  36.57 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  37.5 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  35.88 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  35.36 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  38.55 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  37.42 
 
 		 173 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  33.72 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  50 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  36.69 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  33.53 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  36.31 
 
 		 166 aa  90.9  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  34.46 
 
 		 173 aa  90.5  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  33.94 
 
 		 165 aa  90.5  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  34.25 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  51.65 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  35.52 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  29.88 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  30.56 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  31.48 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  35.96 
 
 		 169 aa  84  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  45.1 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  33.75 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  29.76 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  32.37 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  43.16 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  30.18 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  30.3 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  31.18 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  29.48 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  30.06 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  29.48 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  32.52 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  29.34 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  31.25 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  31.25 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  31.25 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  31.25 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  30.46 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  30.81 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  31.07 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  41.67 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  28.3 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  28.3 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  36.7 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  36.7 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  36.7 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  44.05 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  27.84 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  35.78 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1972  prepilin-type cleavage/methylation  30.99 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  35.78 
 
 		 205 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  28.12 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  35.78 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  35.78 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  35.78 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  35.78 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2704  type IV pilin, putative  31.03 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  37.93 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  35.96 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  27.84 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  46.88 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  38.3 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  37.89 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  62.22 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  39.81 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  37.08 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  39.39 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  39.39 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  47.37 
 
 		 182 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  64.44 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  39.39 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  60.98 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  35.56 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  59.52 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  32.43 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  37.21 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  35.56 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  39.2 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  38.64 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  33.94 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1388  methylation site containing protein  27.22 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  61.54 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  38.38 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  50 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  31.71 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  35.96 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>