More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0301 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  73.25 
 
 		 161 aa  243  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 159 aa  236  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  70.7 
 
 		 162 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  63.92 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 166 aa  207  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 166 aa  207  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 166 aa  207  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  63.87 
 
 		 166 aa  207  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  47.74 
 
 		 155 aa  157  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  51.61 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 169 aa  150  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  49.03 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  49.03 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  48.39 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  45.75 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  46.79 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  46.79 
 
 		 229 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  46.15 
 
 		 229 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  46.79 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  46.79 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  46.79 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  46.79 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  47.4 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  47.37 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  47.37 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 153 aa  141  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 175 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.48 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  45.51 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 155 aa  140  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  47.4 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 213 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  46.05 
 
 		 172 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  46.79 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  48.72 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  41.82 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 157 aa  134  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  42.11 
 
 		 171 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 171 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  42.11 
 
 		 222 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  42.11 
 
 		 171 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 222 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  42.11 
 
 		 171 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  42.26 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  42.26 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  43.59 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  42.95 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  45.16 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.36 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>